More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2935 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  85.65 
 
 
453 aa  820    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1054  aminotransferase class-III  87.11 
 
 
453 aa  820    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  100 
 
 
454 aa  931    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  63.43 
 
 
446 aa  586  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  61.47 
 
 
444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  56.86 
 
 
441 aa  525  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  56.48 
 
 
439 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  56.25 
 
 
451 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  37.28 
 
 
432 aa  236  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.81 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  34.96 
 
 
441 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  33.85 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  34.19 
 
 
447 aa  219  7e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  35.2 
 
 
446 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  34.56 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  33.85 
 
 
431 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  34.19 
 
 
448 aa  204  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  33.26 
 
 
459 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.07 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  32.69 
 
 
452 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  33.87 
 
 
442 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.69 
 
 
445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  32.76 
 
 
452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  33.1 
 
 
442 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  32.98 
 
 
465 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  31.26 
 
 
460 aa  183  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  32.83 
 
 
439 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.76 
 
 
458 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  30.94 
 
 
440 aa  177  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  33.02 
 
 
417 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 
417 aa  176  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  31.82 
 
 
454 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  29.78 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  32.45 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  31.89 
 
 
427 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.32 
 
 
454 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.32 
 
 
454 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  30.73 
 
 
418 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  31.52 
 
 
428 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.05 
 
 
454 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  31.65 
 
 
462 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  31.05 
 
 
468 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  30.98 
 
 
465 aa  170  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 
454 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 
454 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  32.62 
 
 
419 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 
478 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 
454 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  31.41 
 
 
397 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  31.47 
 
 
418 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  29.36 
 
 
401 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  29.96 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.48 
 
 
398 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  31.65 
 
 
399 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 
479 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  30.21 
 
 
427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  32.93 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  31.21 
 
 
397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.59 
 
 
446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.63 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  32.11 
 
 
396 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.66 
 
 
399 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  29.98 
 
 
445 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.68 
 
 
402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  32.89 
 
 
438 aa  163  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  31.45 
 
 
394 aa  163  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3784  aminotransferase class-III  30.8 
 
 
460 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  30.04 
 
 
471 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  30.84 
 
 
454 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  31.39 
 
 
440 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1089  acetylornithine aminotransferase  31.36 
 
 
375 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  32.21 
 
 
402 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  30.66 
 
 
419 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  30.91 
 
 
403 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  30.38 
 
 
411 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  29.78 
 
 
399 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  29.52 
 
 
396 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  30.81 
 
 
391 aa  159  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  29.47 
 
 
403 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  29.47 
 
 
403 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  31.36 
 
 
403 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.83 
 
 
385 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  31.83 
 
 
386 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  30.6 
 
 
386 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  30.56 
 
 
453 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  31.37 
 
 
425 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.23 
 
 
375 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.34 
 
 
400 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 
430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0503  acetylornithine aminotransferase  31.71 
 
 
376 aa  156  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  30.86 
 
 
405 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  28.91 
 
 
403 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  31.84 
 
 
431 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.74 
 
 
427 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  31.41 
 
 
392 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  30.48 
 
 
411 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0169  N2-acetyl-L-lysine aminotransferase / acetylornithine aminotransferase  31 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000199062  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31 
 
 
396 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  31.05 
 
 
399 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  30.9 
 
 
396 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>