More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1272 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  78.84 
 
 
449 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  96.16 
 
 
442 aa  853    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  100 
 
 
440 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  80.51 
 
 
450 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  100 
 
 
440 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  81.4 
 
 
451 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  63.85 
 
 
424 aa  531  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  63.04 
 
 
433 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  59.12 
 
 
479 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  61.74 
 
 
500 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  57.47 
 
 
467 aa  488  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  52.86 
 
 
453 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  48.17 
 
 
439 aa  440  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  52.41 
 
 
449 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  46.92 
 
 
443 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  48.98 
 
 
452 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  34.31 
 
 
488 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  32.8 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  32.22 
 
 
500 aa  170  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0293051 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  29.55 
 
 
498 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  31.25 
 
 
501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  31.7 
 
 
397 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  32.15 
 
 
427 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  27.9 
 
 
491 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  29.59 
 
 
451 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  30.96 
 
 
422 aa  153  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.03 
 
 
413 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  31.14 
 
 
405 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.05 
 
 
387 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.48 
 
 
397 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.07 
 
 
399 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  29.2 
 
 
391 aa  150  6e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  28.43 
 
 
426 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  29.08 
 
 
452 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  29.36 
 
 
441 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  33.76 
 
 
404 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  32.68 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.68 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  33.5 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  31.39 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  28.43 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  30.56 
 
 
403 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  28.61 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  29.81 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  27.65 
 
 
417 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  28.71 
 
 
418 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  28.71 
 
 
418 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.14 
 
 
397 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  27.71 
 
 
393 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  29.27 
 
 
403 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  29.27 
 
 
403 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  30.77 
 
 
418 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  29.61 
 
 
403 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  29.81 
 
 
386 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  30.94 
 
 
403 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  29.9 
 
 
386 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.13 
 
 
399 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1167  aminotransferase class-III  32.99 
 
 
381 aa  144  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000969494 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  27.41 
 
 
417 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.71 
 
 
446 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1404  aminotransferase class-III  31.98 
 
 
383 aa  143  6e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.443564  normal  0.505281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.12 
 
 
398 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.81 
 
 
477 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  27.86 
 
 
439 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  31.59 
 
 
402 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  30.43 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  29.8 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  28.24 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  27.7 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1923  aminotransferase class-III  31.25 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.779903  normal  0.0552026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  29.36 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  31.19 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.71 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  28.72 
 
 
397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  27.25 
 
 
392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  29.18 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  27.63 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  27.97 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  29.55 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  27.63 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  28.05 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.78 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  28.64 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  28.44 
 
 
429 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.02 
 
 
427 aa  140  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  28.2 
 
 
429 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  30.05 
 
 
407 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  31.11 
 
 
404 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  30.52 
 
 
403 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  26.63 
 
 
393 aa  139  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15001  acetylornithine aminotransferase  26.91 
 
 
391 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  27.87 
 
 
420 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  30.05 
 
 
392 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  29.18 
 
 
465 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  28.2 
 
 
459 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  28.2 
 
 
468 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  29.27 
 
 
437 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  28.2 
 
 
459 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  28.2 
 
 
429 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  29.78 
 
 
395 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>