More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2373 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  100 
 
 		 479 aa  956    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  76.68 
 
 		 500 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  64.75 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  65.79 
 
 		 433 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  60.43 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  58.8 
 
 		 449 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  59.12 
 
 		 440 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  59.12 
 
 		 440 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  58.89 
 
 		 442 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  57.34 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  52.97 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  50.69 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  46.1 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  45.21 
 
 		 439 aa  425  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  47.96 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  43.95 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  31.25 
 
 		 498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  32.31 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  30.66 
 
 		 491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  30.63 
 
 		 501 aa  182  9.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  30.19 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  31.21 
 
 		 470 aa  166  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  30.5 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  28.24 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  31.33 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  27.65 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  28.74 
 
 		 386 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  30 
 
 		 405 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.86 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  34.05 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0283  aminotransferase  32.31 
 
 		 392 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  27.27 
 
 		 386 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  28.96 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  28.34 
 
 		 446 aa  127  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  26.78 
 
 		 386 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  27.83 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  28.25 
 
 		 471 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4554  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.92 
 
 		 404 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  30.37 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1923  aminotransferase class-III  31.44 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.779903  normal  0.0552026 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  26.7 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  30.14 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  28.11 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  28.27 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  32.7 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.4 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  29.35 
 
 		 426 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  29.05 
 
 		 425 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  27.06 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  28.83 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  29.05 
 
 		 425 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  29.05 
 
 		 425 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1167  aminotransferase class-III  31.7 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000969494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  28.32 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  29.08 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  26.83 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  32.46 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  29.08 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  27.51 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  26.56 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  29.08 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  29.08 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.61 
 
 		 400 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  25.93 
 
 		 462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  29.49 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  26.56 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  29.11 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  28.57 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  31.09 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0961  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  26.12 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.871342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15001  acetylornithine aminotransferase  25.31 
 
 		 391 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  30.07 
 
 		 398 aa  120  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  30.5 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  29.51 
 
 		 417 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1404  aminotransferase class-III  29.98 
 
 		 383 aa  120  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.443564  normal  0.505281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  29.64 
 
 		 403 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02293  acetylornithine transaminase protein  31.75 
 
 		 408 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  28.15 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  31.53 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  29.94 
 
 		 426 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  30.33 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  26.78 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  26.25 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  28.61 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  30.32 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0767  aminotransferase class-III  29.14 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000633967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  29.77 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  28.51 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  28.8 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  27.55 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  31.32 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  28.8 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  26 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3654  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  25.43 
 
 		 439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  28.03 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  30.53 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  25.81 
 
 		 387 aa  118  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  24.82 
 
 		 394 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  31.51 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>