More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2873 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  100 
 
 		 500 aa  984    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  78.29 
 
 		 479 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  67.29 
 
 		 424 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  66.99 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  64.06 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  60.6 
 
 		 450 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  61.4 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  61.4 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  61.16 
 
 		 442 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  60 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  50 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  51.28 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  46.26 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  45.08 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  47.7 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  43.96 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  32.75 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  28.85 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  30.11 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  28.27 
 
 		 498 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  29.91 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  30.37 
 
 		 470 aa  161  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  29.04 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  26.91 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  31.34 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  30.19 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  31.02 
 
 		 397 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  28.67 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  28.25 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  29.61 
 
 		 435 aa  133  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  27.51 
 
 		 386 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  29 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0767  aminotransferase class-III  29.95 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000633967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  26.54 
 
 		 386 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  29.45 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  28.26 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  29.22 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  29.95 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  29.38 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1923  aminotransferase class-III  31.08 
 
 		 381 aa  126  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.779903  normal  0.0552026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  28.11 
 
 		 401 aa  126  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  29.34 
 
 		 414 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2229  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  29.34 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  30.57 
 
 		 432 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.53 
 
 		 400 aa  126  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  31.18 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  31.77 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  29.37 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2520  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  29.34 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  31.11 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  28.47 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  28.57 
 
 		 440 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  29.43 
 
 		 403 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 		 427 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  28.71 
 
 		 427 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  29.1 
 
 		 405 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  26.24 
 
 		 420 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  27.96 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.16 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  29.55 
 
 		 386 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.8 
 
 		 413 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  27.03 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  27.03 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  26.4 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  30.02 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  28.5 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  26.45 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  29.91 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.05 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  28.16 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0283  aminotransferase  31.25 
 
 		 392 aa  121  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0686  acetylornithine transaminase protein  31.06 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  30.7 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  29.62 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0774  acetylornithine transaminase protein  31.06 
 
 		 411 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  28.36 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.27 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1404  aminotransferase class-III  30.5 
 
 		 383 aa  120  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.443564  normal  0.505281 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  28.12 
 
 		 452 aa  120  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  28.5 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  27.86 
 
 		 386 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.12 
 
 		 375 aa  120  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  30.26 
 
 		 395 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  27.78 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  28.93 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  34.04 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2808  acetylornithine aminotransferase  30.77 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.48 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  27.78 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  28.06 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  29.59 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52948  acetylornithine aminotransferase  24.9 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.346975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  27.66 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  28.26 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  27.16 
 
 		 426 aa  118  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  27.16 
 
 		 426 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  25.12 
 
 		 394 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  27.16 
 
 		 426 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  29.57 
 
 		 391 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  25.63 
 
 		 401 aa  118  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>