More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2682 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  78.93 
 
 		 433 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  100 
 
 		 424 aa  864    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  67.21 
 
 		 500 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  64.75 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  64.99 
 
 		 450 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  63.85 
 
 		 440 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  63.85 
 
 		 440 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  63.64 
 
 		 442 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  62.7 
 
 		 449 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  62.41 
 
 		 451 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  54.94 
 
 		 467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  51.38 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  52.67 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  51.89 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  47.7 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  49.2 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  32.49 
 
 		 488 aa  180  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  31.86 
 
 		 501 aa  172  7.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  32.09 
 
 		 500 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  30.34 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  30.46 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  32.84 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  31.06 
 
 		 441 aa  163  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  30.24 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  31.48 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  31.09 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  30.97 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  30.77 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  29.18 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  31.19 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  29.37 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  29.63 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  29 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.53 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1054  aminotransferase class-III  30.17 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  30.54 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  30.98 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  29.83 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  30.07 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  29.93 
 
 		 451 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  32.13 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  30.3 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  30.3 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  29.74 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  30.22 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  29.8 
 
 		 386 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4554  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.18 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  30.17 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  28.68 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  29.31 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.29 
 
 		 410 aa  136  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  31.4 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  29.18 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  29.78 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  28.5 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  28.75 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.28 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  29.78 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  31.67 
 
 		 440 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  29.54 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  31.05 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  31.09 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  31.11 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  29.54 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  30.35 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  28.11 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.93 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  27.94 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  30.35 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.57 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.8 
 
 		 446 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  28.03 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  30.49 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  29.68 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  27.7 
 
 		 385 aa  131  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  30.12 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.49 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  28.61 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  29.88 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.47 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  29.88 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.36 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  30.79 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  29.13 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0503  acetylornithine aminotransferase  28.26 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  29.14 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  28.68 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  30.15 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  29.23 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  30.69 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  30.5 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  30.52 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  30.79 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  29.3 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  30.28 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  27.75 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.91 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  27.79 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  27.74 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  30.41 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>