More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1717 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  100 
 
 		 449 aa  923    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  55.17 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  52.64 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  52.63 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  51.71 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  54.14 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  51.94 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  52.64 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  52.41 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  52.41 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  52.67 
 
 		 424 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  49.77 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  51.38 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  50.59 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  47.96 
 
 		 479 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  47.59 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  32.05 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  34.32 
 
 		 500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  31.03 
 
 		 488 aa  196  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  29.59 
 
 		 498 aa  182  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  30.52 
 
 		 491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  29.71 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  30.19 
 
 		 452 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  33.82 
 
 		 419 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  31.39 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  29.62 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  29.07 
 
 		 439 aa  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  29.84 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  29.64 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  29.6 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  30.4 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  30.77 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  29.35 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  30.12 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  31.97 
 
 		 426 aa  154  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  32.43 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  30.61 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  27.95 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  26.86 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  31.48 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  31.48 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  28.81 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  29.58 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  31.23 
 
 		 426 aa  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  31.48 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  31.48 
 
 		 426 aa  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  29.34 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  31.48 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  31.48 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  32.8 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  30.81 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  30.41 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  30.2 
 
 		 430 aa  150  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  31.22 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  28.84 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  31.09 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  28.61 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.88 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  28.19 
 
 		 454 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  31.96 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  30.48 
 
 		 398 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  30.66 
 
 		 418 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  28.41 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  29.77 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  30.72 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  29.77 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  30.28 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  29.77 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.83 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  31.87 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  31.38 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  29.34 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.34 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  29.24 
 
 		 398 aa  144  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  31.09 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  30.23 
 
 		 429 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  28.22 
 
 		 398 aa  144  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  31.84 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  30.24 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  30.15 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  29.93 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  29.37 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.38 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  28.88 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  29.53 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  29.77 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  31.62 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  29.4 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  28.1 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  29.02 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  30.88 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2287  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  28.54 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  29.23 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  26.65 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  31.62 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  31.6 
 
 		 426 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  28.57 
 
 		 454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>