More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02040 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  100 
 
 
488 aa  1017    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  53 
 
 
501 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  51.12 
 
 
498 aa  509  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  46.33 
 
 
491 aa  458  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  48.16 
 
 
470 aa  434  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  43.33 
 
 
500 aa  402  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  32.33 
 
 
453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  30.73 
 
 
443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  29.96 
 
 
439 aa  206  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  32.65 
 
 
467 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  33.49 
 
 
450 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  34.54 
 
 
442 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  34.31 
 
 
440 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  34.31 
 
 
440 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  32.13 
 
 
451 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  32.71 
 
 
449 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  30.11 
 
 
449 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  32.49 
 
 
424 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  30.19 
 
 
479 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  30.7 
 
 
500 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  33.25 
 
 
433 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  29.41 
 
 
452 aa  167  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  26.51 
 
 
439 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  26.62 
 
 
431 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  28.18 
 
 
444 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  26.6 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  27.45 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  26.91 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  25.96 
 
 
465 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  26.99 
 
 
459 aa  140  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  26.99 
 
 
441 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  28.03 
 
 
439 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  28.79 
 
 
448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  26.19 
 
 
432 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  26.81 
 
 
461 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  27.44 
 
 
446 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  26.67 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  25.11 
 
 
448 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  26.17 
 
 
446 aa  127  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  27.96 
 
 
427 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  25.37 
 
 
444 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  27.8 
 
 
427 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  27.8 
 
 
429 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  27.8 
 
 
429 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  27.8 
 
 
429 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  25.62 
 
 
454 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  27.58 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  27.76 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  27.74 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  26.22 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  27.4 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  27.01 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  25.96 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  26.2 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  26.79 
 
 
452 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  26.26 
 
 
441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  25.18 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  28.54 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  26.07 
 
 
427 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  25.29 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  25.74 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  27.52 
 
 
427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  26.73 
 
 
426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.34 
 
 
416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.71 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  25.51 
 
 
422 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.85 
 
 
430 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  24.94 
 
 
427 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  27.25 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  27.21 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  25.18 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.3 
 
 
436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  25.42 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  25.18 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  25.59 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  26.17 
 
 
419 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  26.17 
 
 
411 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  25.96 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1054  aminotransferase class-III  25.87 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  27.65 
 
 
446 aa  114  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  24.95 
 
 
471 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  25.65 
 
 
393 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  26.68 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  24.67 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  25.63 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  25.97 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  24.66 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  27.27 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  24.29 
 
 
399 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.34 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4207  aminotransferase class-III  26.51 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  26.33 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3083  aminotransferase  26.23 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  26.39 
 
 
398 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  25.82 
 
 
411 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  27.21 
 
 
419 aa  110  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  27.82 
 
 
434 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  25.64 
 
 
413 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  25.28 
 
 
399 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  25.4 
 
 
398 aa  110  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>