More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1652 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  76.46 
 
 
449 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  84.95 
 
 
450 aa  724    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  81.4 
 
 
440 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  81.25 
 
 
442 aa  691    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  81.4 
 
 
440 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  100 
 
 
451 aa  911    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  63.64 
 
 
433 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  62.41 
 
 
424 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  57.08 
 
 
467 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  60.09 
 
 
500 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  57.34 
 
 
479 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  54.61 
 
 
453 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  49.43 
 
 
439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  51.71 
 
 
449 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  48.05 
 
 
443 aa  428  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  47.87 
 
 
452 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  32.13 
 
 
488 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  30.41 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  32.24 
 
 
500 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  31.25 
 
 
501 aa  160  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  31.81 
 
 
470 aa  159  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  29.51 
 
 
461 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.26 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  30.55 
 
 
418 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  29.02 
 
 
491 aa  153  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  28.43 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  28.64 
 
 
427 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  30.81 
 
 
395 aa  146  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02293  acetylornithine transaminase protein  32.37 
 
 
408 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  29.38 
 
 
451 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  30.79 
 
 
398 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  28.78 
 
 
418 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  30.66 
 
 
441 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  28.78 
 
 
418 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  29.25 
 
 
453 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  28.27 
 
 
439 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  30.43 
 
 
401 aa  144  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.71 
 
 
413 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  30.24 
 
 
397 aa  142  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  30.46 
 
 
404 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  31.87 
 
 
403 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  29.09 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  27.88 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  31.63 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  30.91 
 
 
386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  28.92 
 
 
386 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4554  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.62 
 
 
404 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  30.02 
 
 
446 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  30.58 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  31.72 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  28.09 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  28.09 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  28.09 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  30.9 
 
 
396 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  28.64 
 
 
385 aa  140  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  31.46 
 
 
427 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  28.43 
 
 
403 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  29.22 
 
 
427 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  30.79 
 
 
422 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  31.97 
 
 
394 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  26.89 
 
 
387 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  27.42 
 
 
437 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  30.79 
 
 
403 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  28.44 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  27.75 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  29.98 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  30.64 
 
 
426 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  28.2 
 
 
404 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  30.64 
 
 
426 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  29.8 
 
 
397 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  27.1 
 
 
417 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  27.71 
 
 
471 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  29.86 
 
 
426 aa  136  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  29.86 
 
 
426 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  29.86 
 
 
426 aa  136  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  28.04 
 
 
426 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22030  ornithine/acetylornithine aminotransferase  30.07 
 
 
402 aa  136  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00254086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  30.5 
 
 
426 aa  136  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  27.97 
 
 
444 aa  136  9e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  28.67 
 
 
427 aa  136  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0686  acetylornithine transaminase protein  31.82 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  30.43 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  30.73 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  28.16 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.63 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  28.44 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  28.22 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0774  acetylornithine transaminase protein  31.82 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.85 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  30 
 
 
427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  28.4 
 
 
385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  27.75 
 
 
446 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  28.48 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  27.67 
 
 
398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  29.29 
 
 
386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  27.68 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  28.37 
 
 
428 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  27.75 
 
 
462 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  30 
 
 
399 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>