More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13319 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  78.37 
 
 
442 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  75.66 
 
 
450 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  78.84 
 
 
440 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  100 
 
 
449 aa  909    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  78.84 
 
 
440 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  76.46 
 
 
451 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  64.42 
 
 
500 aa  531  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  63.17 
 
 
424 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  58.8 
 
 
479 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  61.39 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  57.44 
 
 
467 aa  488  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  53.81 
 
 
453 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  48.48 
 
 
439 aa  430  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  46.68 
 
 
443 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  51.38 
 
 
449 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  46.28 
 
 
452 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  32.71 
 
 
488 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  32.44 
 
 
500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0293051 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  30.13 
 
 
498 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  30.61 
 
 
501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  31.72 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  30.88 
 
 
491 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  29.98 
 
 
451 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  31.46 
 
 
405 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  31.73 
 
 
418 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  29.06 
 
 
385 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  29.06 
 
 
426 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  29.29 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.33 
 
 
387 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  28.57 
 
 
385 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.33 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  28.4 
 
 
391 aa  154  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  29.98 
 
 
441 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  29.44 
 
 
452 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  31.54 
 
 
403 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  30.75 
 
 
427 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  28.61 
 
 
417 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  32.49 
 
 
403 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.82 
 
 
413 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  32.03 
 
 
396 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  29.93 
 
 
427 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  30.77 
 
 
401 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  28.5 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  31.17 
 
 
403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  28.43 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  33 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  30.25 
 
 
422 aa  146  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  28.4 
 
 
393 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  30.9 
 
 
407 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  28.84 
 
 
453 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  29.44 
 
 
418 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  28.89 
 
 
418 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  27.49 
 
 
392 aa  144  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  29.78 
 
 
395 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  30.66 
 
 
432 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  28.47 
 
 
444 aa  143  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.68 
 
 
427 aa  143  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  32.03 
 
 
429 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  32.99 
 
 
394 aa  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  27.19 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  29.55 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  27.49 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  29.24 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  31.25 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15001  acetylornithine aminotransferase  27.63 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  30.84 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.34 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  28.68 
 
 
397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  33.92 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  30.22 
 
 
399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  29.8 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  28.37 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  30.66 
 
 
427 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4554  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.69 
 
 
404 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  30.47 
 
 
465 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  28.3 
 
 
419 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  29.47 
 
 
445 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  27.46 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  29.19 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.62 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  31.54 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  31.54 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  28.37 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  31.78 
 
 
429 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  29.83 
 
 
386 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.07 
 
 
388 aa  140  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  31.54 
 
 
427 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  31.07 
 
 
388 aa  140  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  28.99 
 
 
386 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  26.97 
 
 
391 aa  140  7e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  31.78 
 
 
446 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  31.4 
 
 
440 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.22 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  31.54 
 
 
427 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  27.47 
 
 
401 aa  139  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  28.33 
 
 
446 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.86 
 
 
398 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  28.64 
 
 
465 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  31.68 
 
 
408 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.5 
 
 
397 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>