More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7678 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  100 
 
 		 433 aa  878    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  77.78 
 
 		 424 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  66.98 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  65.26 
 
 		 479 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  64.34 
 
 		 450 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  62.97 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  61.88 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  62.26 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  62.26 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  60.42 
 
 		 449 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  55.14 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  49.65 
 
 		 453 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  45.83 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  49.66 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  48.86 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  46.1 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  33.25 
 
 		 488 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  31.94 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  30.6 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  32.3 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  31.71 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  29.76 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  28.98 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  29.67 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  30.41 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  31.12 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  30 
 
 		 453 aa  149  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  32.45 
 
 		 397 aa  149  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  29.51 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  32.14 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  32.93 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  31.48 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  29.84 
 
 		 454 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  28.37 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  28.81 
 
 		 386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1054  aminotransferase class-III  30 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2935  aminotransferase class-III  30 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  32.29 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  30.81 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  29.27 
 
 		 386 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.23 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  29.98 
 
 		 426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  29.98 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  30.49 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  29.98 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  30.49 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  30.49 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  28.81 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.47 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  33.84 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  31.08 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  30.84 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  32.86 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  30.9 
 
 		 471 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  29.62 
 
 		 426 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  28.37 
 
 		 446 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.54 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  28.81 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  28.81 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  30.51 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  29.29 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  28.77 
 
 		 386 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  28.81 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  30.02 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2207  aminotransferase class-III  28.47 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85237  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  29.14 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52948  acetylornithine aminotransferase  27.7 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.346975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  28.17 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02293  acetylornithine transaminase protein  32.03 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  28.85 
 
 		 427 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  30.24 
 
 		 422 aa  130  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.04 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  32.76 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  31.28 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  29.34 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  28.97 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  29.57 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  29.64 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.61 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.1 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  31.31 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  29.64 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.08 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  31.96 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  30.79 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  29.88 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  29.09 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  29.25 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.6 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  29.27 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0914  acetylornithine aminotransferase  29.34 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1733  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  28.81 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  27.9 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  28.74 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  30.98 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  30.75 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  28.95 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  28.35 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  29.87 
 
 		 397 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>