More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0464 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  100 
 
 
439 aa  906    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  56.72 
 
 
467 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  51.72 
 
 
453 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  52.64 
 
 
449 aa  478  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  49.43 
 
 
443 aa  465  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  49.88 
 
 
450 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  49.43 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  48.98 
 
 
452 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  48.17 
 
 
440 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  48.17 
 
 
440 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  48.74 
 
 
442 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  51.89 
 
 
424 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  45.21 
 
 
479 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  48.48 
 
 
449 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  44.95 
 
 
500 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  46.56 
 
 
433 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  30.92 
 
 
498 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  29.96 
 
 
488 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  29.52 
 
 
491 aa  199  9e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  30.07 
 
 
470 aa  193  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  30.25 
 
 
501 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  29.21 
 
 
500 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  32.08 
 
 
444 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  31.54 
 
 
392 aa  179  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  27.7 
 
 
439 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  29.31 
 
 
441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  29.05 
 
 
393 aa  167  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  29.81 
 
 
454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  30.64 
 
 
418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  30.43 
 
 
426 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  28.47 
 
 
452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  29.22 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 
454 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 
478 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 
454 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  28.87 
 
 
454 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  29.11 
 
 
454 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 
468 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 
454 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 
454 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 
454 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  29.11 
 
 
479 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  30.98 
 
 
400 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  30.24 
 
 
391 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  28.88 
 
 
427 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.05 
 
 
399 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  28.04 
 
 
448 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  31.57 
 
 
390 aa  159  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.33 
 
 
427 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  28.44 
 
 
422 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  30.73 
 
 
394 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  29.12 
 
 
393 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  29.1 
 
 
397 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  28.97 
 
 
434 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  28.94 
 
 
461 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0252  acetylornithine aminotransferase  28.88 
 
 
393 aa  156  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  28.2 
 
 
423 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  30.9 
 
 
386 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  28.14 
 
 
441 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.4 
 
 
387 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  30.46 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  28 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  27.42 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  29.72 
 
 
411 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  30.44 
 
 
427 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  28.74 
 
 
418 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52948  acetylornithine aminotransferase  28.3 
 
 
452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.346975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  28.74 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  28.83 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  28.27 
 
 
419 aa  153  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  27.99 
 
 
451 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.66 
 
 
387 aa  152  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  28.05 
 
 
403 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  29.95 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  30.47 
 
 
417 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 
453 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  28.95 
 
 
399 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  27.3 
 
 
403 aa  151  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.02 
 
 
385 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  29.31 
 
 
435 aa  151  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  27.3 
 
 
403 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15001  acetylornithine aminotransferase  30 
 
 
391 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  30.2 
 
 
398 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  31.85 
 
 
462 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  29.45 
 
 
393 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  27.47 
 
 
394 aa  150  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.24 
 
 
395 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  26.68 
 
 
403 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  28.1 
 
 
401 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  29.48 
 
 
442 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.2 
 
 
472 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  28.5 
 
 
399 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  26.35 
 
 
430 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  29.62 
 
 
420 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  29.74 
 
 
394 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  28.37 
 
 
417 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.23 
 
 
399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  28.33 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  29.34 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  28.27 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>