More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4796 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1301  L-lysine aminotransferase  79.64 
 
 
442 aa  698    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1272  L-lysine aminotransferase  79.86 
 
 
440 aa  699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4796  L-lysine aminotransferase  100 
 
 
450 aa  910    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267595  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1289  L-lysine aminotransferase  79.86 
 
 
440 aa  699    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273744  normal  0.422554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1652  L-lysine aminotransferase  84.95 
 
 
451 aa  739    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13319  L-lysine aminotransferase  75.06 
 
 
449 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2682  L-lysine 6-transaminase  63.93 
 
 
424 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7678  L-lysine aminotransferase  64.34 
 
 
433 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2373  L-lysine aminotransferase  59.09 
 
 
479 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2873  L-lysine aminotransferase  59.91 
 
 
500 aa  502  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0317719  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2194  L-lysine 6-transaminase  56.95 
 
 
467 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2442  L-lysine aminotransferase  54 
 
 
453 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1717  L-lysine 6-transaminase  52.98 
 
 
449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0464  L-lysine 6-transaminase  49.09 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00767316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1211  L-lysine aminotransferase  48.74 
 
 
443 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.992167 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1141  L-lysine 6-transaminase  49.2 
 
 
452 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0300447  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02040  4-aminobutyrate transaminase, putative  33.33 
 
 
488 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0278782  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02248  4-aminobutyrate aminotransferase (EC 2.6.1.19)(Gamma-amino-N-butyrate transaminase)(GABA transaminase)(GABA aminotransferase)(GABA-AT) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P14010]  31.01 
 
 
498 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0439311  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38108  predicted protein  32.74 
 
 
500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01830  4-aminobutyrate aminotransferase, putative  31.54 
 
 
501 aa  179  7e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46781  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  31.49 
 
 
470 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54153  4-aminobutyrate aminotransferase (GABA transaminase)  28.77 
 
 
491 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1072  aminotransferase class-III  29.63 
 
 
439 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  29.76 
 
 
461 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  30.66 
 
 
401 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0810  aminotransferase class-III  31.58 
 
 
441 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  29.78 
 
 
427 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  27.74 
 
 
392 aa  155  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1690  aminotransferase class-III  30.81 
 
 
451 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  31.08 
 
 
398 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  29.55 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.29 
 
 
427 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  29.83 
 
 
431 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  28.5 
 
 
426 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  29.56 
 
 
385 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.49 
 
 
413 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  31.42 
 
 
405 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  30.62 
 
 
396 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  28.47 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  31.25 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  28.54 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  31.3 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  28.5 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  30.39 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  28.82 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  31.86 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  27.98 
 
 
391 aa  147  5e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  32.11 
 
 
426 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  31.87 
 
 
394 aa  147  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  31.86 
 
 
426 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  30.27 
 
 
422 aa  146  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  29.64 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  31.31 
 
 
428 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  30.71 
 
 
426 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  27.09 
 
 
387 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  30.29 
 
 
404 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  28.26 
 
 
427 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  31.62 
 
 
404 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  30.71 
 
 
426 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  29.13 
 
 
437 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  27.54 
 
 
418 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  27.73 
 
 
419 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0686  acetylornithine transaminase protein  32.61 
 
 
411 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  27.54 
 
 
418 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  31.86 
 
 
426 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  31.62 
 
 
426 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  33.24 
 
 
440 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  30.77 
 
 
427 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  31.86 
 
 
426 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  28.99 
 
 
465 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  26.76 
 
 
417 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0774  acetylornithine transaminase protein  32.61 
 
 
411 aa  143  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2199  aminotransferase class-III  29.85 
 
 
446 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  29.25 
 
 
395 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  29.02 
 
 
419 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  28.9 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  30.62 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  29.69 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  27.89 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  27.03 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3291  acetylornithine transaminase protein  32.43 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3776  aminotransferase class-III  27.66 
 
 
453 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  27.64 
 
 
386 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  29.41 
 
 
397 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2733  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  29.27 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  30.52 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  27.18 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  29.5 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  30.75 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4554  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.11 
 
 
404 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  29.52 
 
 
407 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  31.33 
 
 
427 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  28.05 
 
 
403 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  27.74 
 
 
403 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  30.07 
 
 
432 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  27.54 
 
 
386 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  27.74 
 
 
403 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  30.35 
 
 
417 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  26.28 
 
 
417 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  27.25 
 
 
446 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>