More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0809 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  100 
 
 
462 aa  952    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  64.77 
 
 
477 aa  614  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  61.71 
 
 
477 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  62.14 
 
 
463 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  61.49 
 
 
463 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  61.64 
 
 
453 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  60.61 
 
 
463 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  61.27 
 
 
463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  60.61 
 
 
463 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  60.13 
 
 
463 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  53.44 
 
 
458 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  53.49 
 
 
457 aa  521  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  54.61 
 
 
457 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0761  aminotransferase class-III  47.84 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3098  aminotransferase  44.55 
 
 
449 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2601  aminotransferase class-III  40.88 
 
 
451 aa  353  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  37.89 
 
 
475 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  40.6 
 
 
460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  35.84 
 
 
462 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  40.55 
 
 
467 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  38.99 
 
 
463 aa  329  7e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  41.29 
 
 
468 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  37.96 
 
 
475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  35.02 
 
 
460 aa  297  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  38.27 
 
 
845 aa  290  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  37.8 
 
 
411 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  35.65 
 
 
411 aa  259  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  35.65 
 
 
891 aa  256  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.94 
 
 
459 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.67 
 
 
459 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.67 
 
 
459 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.67 
 
 
459 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.67 
 
 
459 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.67 
 
 
429 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.67 
 
 
459 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.67 
 
 
429 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  39.67 
 
 
468 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  39.67 
 
 
429 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  37.65 
 
 
396 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  37.65 
 
 
396 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.67 
 
 
429 aa  249  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  37.65 
 
 
396 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  39.67 
 
 
459 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.98 
 
 
429 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  37.65 
 
 
396 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  37.41 
 
 
396 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  37.17 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  37.17 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  37.17 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  37.17 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  37.17 
 
 
396 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.63 
 
 
457 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.21 
 
 
459 aa  242  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.32 
 
 
472 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.89 
 
 
472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.25 
 
 
477 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  37.23 
 
 
403 aa  239  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2968  aminotransferase class-III  34.03 
 
 
471 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  36.71 
 
 
396 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  36.58 
 
 
402 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.25 
 
 
477 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  32.54 
 
 
955 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  36.83 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  36.54 
 
 
400 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.34 
 
 
393 aa  234  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  35.64 
 
 
386 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.86 
 
 
395 aa  233  8.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0851  aminotransferase, class III  33.33 
 
 
484 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  33.56 
 
 
398 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  35.51 
 
 
399 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0799  aminotransferase, class III  33.1 
 
 
484 aa  229  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  37.14 
 
 
422 aa  229  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  36.93 
 
 
414 aa  229  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.55 
 
 
385 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.07 
 
 
391 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  33.58 
 
 
394 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  37.65 
 
 
415 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  36.32 
 
 
410 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  34.09 
 
 
386 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  34.44 
 
 
441 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  35.95 
 
 
418 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  33.17 
 
 
386 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  34.41 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  34.69 
 
 
396 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  33.25 
 
 
386 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  36.1 
 
 
430 aa  223  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  36.29 
 
 
386 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  34.31 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  33.26 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.99 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  36.27 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  35.09 
 
 
386 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  34.49 
 
 
386 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.51 
 
 
393 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  35.71 
 
 
402 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  35.28 
 
 
386 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0434  aminotransferase class-III  32.06 
 
 
459 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  34.79 
 
 
386 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  35.76 
 
 
419 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  34.33 
 
 
454 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>