92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6042 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6042  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 333 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.184263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2275  LuxR family transcriptional regulator  95.8 
 
 		 333 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.074961  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3737  LuxR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354722  normal  0.0596552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4232  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0856  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1751  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 376 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4755  LuxR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 301 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5426  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967948  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4858  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3508  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.581522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2240  LuxR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 236 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3738  LuxR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 277 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.573262  normal  0.0137717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1750  hypothetical protein  28.31 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0857  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4754  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4231  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0916  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.4 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1002  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.4 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0081  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.4 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1159  hypothetical protein  27.4 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.634335  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2245  hypothetical protein  27.4 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3509  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0799611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4857  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5427  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370674  normal  0.235662 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  24.51 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 242 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 243 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 235 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4509  autoinducer-binding domain-containing protein  23.62 
 
 		 235 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  25.96 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 230 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  22.97 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  22.97 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  22.97 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.97 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4647  LuxR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2142  hypothetical protein  31.52 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.532898  normal  0.0656443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  23.53 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  45.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  23.64 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  25.1 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  24.38 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 236 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  25.1 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.67 
 
 		 213 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2151  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.639034  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  23.77 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2062  LuxR family DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2085  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.844485  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  33.33 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  23.58 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  22.54 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6046  two component LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 502 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  22.79 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 192 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  22.47 
 
 		 213 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  20.91 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  22.27 
 
 		 233 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 938 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 233 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.08 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  24.34 
 
 		 245 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 995 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  24.64 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 240 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  28.71 
 
 		 868 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3181  sigma-70, region 4 type 2  33.75 
 
 		 198 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 221 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4339  response regulator receiver protein  36 
 
 		 233 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>