41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5427 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4857  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5427  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370674  normal  0.235662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3509  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0799611  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0857  LuxR family transcriptional regulator  92.42 
 
 		 277 aa  524  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4754  LuxR family transcriptional regulator  91.7 
 
 		 277 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4231  LuxR family transcriptional regulator  91.7 
 
 		 277 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3738  LuxR family transcriptional regulator  89.53 
 
 		 277 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.573262  normal  0.0137717 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2245  hypothetical protein  55.8 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1002  ATP-dependent transcription regulator LuxR  55.8 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0081  ATP-dependent transcription regulator LuxR  55.8 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0916  ATP-dependent transcription regulator LuxR  55.8 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1159  hypothetical protein  55.8 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.634335  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1750  hypothetical protein  55.27 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4232  LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3508  LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.581522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5426  LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967948  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0856  LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4858  LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4755  LuxR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 319 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 319 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 319 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2240  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1751  LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 376 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3737  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354722  normal  0.0596552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2275  LuxR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.074961  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6042  transcriptional regulator, LuxR family  25.45 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.184263 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  43.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  42.37 
 
 		 891 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0262  two component LuxR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  35.85 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  38.6 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  33.87 
 
 		 574 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4133  two component LuxR family transcriptional regulator  26 
 
 		 240 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 247 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>