243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4232 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4232  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4755  LuxR family transcriptional regulator  99 
 
 		 301 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0856  LuxR family transcriptional regulator  92.36 
 
 		 301 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5426  LuxR family transcriptional regulator  92.72 
 
 		 302 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967948  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3508  LuxR family transcriptional regulator  92.72 
 
 		 302 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.581522  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4858  LuxR family transcriptional regulator  92.72 
 
 		 302 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3737  LuxR family transcriptional regulator  88.04 
 
 		 298 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354722  normal  0.0596552 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1751  LuxR family transcriptional regulator  64.24 
 
 		 376 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 319 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 319 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 319 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2240  LuxR family transcriptional regulator  71.78 
 
 		 236 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3509  LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0799611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4857  LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5427  LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370674  normal  0.235662 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4754  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4231  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0857  LuxR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3738  LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.573262  normal  0.0137717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2275  LuxR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.074961  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6042  transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.184263 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2245  hypothetical protein  29.69 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1159  hypothetical protein  29.69 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.634335  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0081  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.69 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1002  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.69 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0916  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.69 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1750  hypothetical protein  29.09 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  49.02 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 230 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 206 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4197  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4329  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4008  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 215 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  26.84 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  40.35 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  24.08 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3799  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  27.54 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 		 917 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.89 
 
 		 207 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 938 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4624  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25620  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.11 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  39.22 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  39.34 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 231 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 208 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  22.31 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  44.23 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 215 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1952  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 96 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.801604  normal  0.129884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19850  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 827 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.326832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  22.01 
 
 		 239 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  31.87 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0636  putative GAF sensor protein  35.82 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000883043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  31.87 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  36.99 
 
 		 878 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6014  LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383358  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 1137 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  32.39 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6637  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>