256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3508 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5426  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967948  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3508  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.581522  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4858  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0856  LuxR family transcriptional regulator  94.04 
 
 		 301 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4755  LuxR family transcriptional regulator  92.38 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4232  LuxR family transcriptional regulator  92.72 
 
 		 301 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3737  LuxR family transcriptional regulator  90.4 
 
 		 298 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354722  normal  0.0596552 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 296 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1751  LuxR family transcriptional regulator  67.63 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 296 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2240  LuxR family transcriptional regulator  72.61 
 
 		 236 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3509  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0799611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4857  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5427  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370674  normal  0.235662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4231  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4754  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0857  LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3738  LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.573262  normal  0.0137717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2275  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.074961  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6042  transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 		 333 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.184263 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1159  hypothetical protein  30.13 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.634335  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2245  hypothetical protein  30.13 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0916  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0081  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1002  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1750  hypothetical protein  29.09 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  49.02 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 206 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 230 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  23.51 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4197  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 248 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  24.08 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4329  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 248 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  27.54 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4008  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  23.17 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  40.35 
 
 		 243 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3799  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 		 917 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 938 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4624  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  39.22 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  44.23 
 
 		 231 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  39.34 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 		 207 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 223 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  33.8 
 
 		 233 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1952  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 96 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.801604  normal  0.129884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25620  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.72 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1785  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 228 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  31.87 
 
 		 213 aa  45.8  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  31.87 
 
 		 213 aa  45.8  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 		 268 aa  45.8  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 233 aa  45.8  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6637  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0636  putative GAF sensor protein  35.82 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000883043  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.06 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 1137 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  34.33 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  35.29 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6014  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383358  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  46 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  22.73 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  35.29 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  35.29 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>