42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3738 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3738  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
277 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.573262  normal  0.0137717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4754  LuxR family transcriptional regulator  88.81 
 
 
277 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4231  LuxR family transcriptional regulator  88.81 
 
 
277 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5427  LuxR family transcriptional regulator  89.53 
 
 
277 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370674  normal  0.235662 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4857  LuxR family transcriptional regulator  89.53 
 
 
277 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3509  LuxR family transcriptional regulator  89.53 
 
 
277 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0799611  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0857  LuxR family transcriptional regulator  85.92 
 
 
277 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2245  hypothetical protein  56.83 
 
 
348 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1159  hypothetical protein  56.83 
 
 
274 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.634335  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0081  ATP-dependent transcription regulator LuxR  56.83 
 
 
274 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0916  ATP-dependent transcription regulator LuxR  56.83 
 
 
274 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1002  ATP-dependent transcription regulator LuxR  56.83 
 
 
274 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1750  hypothetical protein  57.19 
 
 
294 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1751  LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
376 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2240  LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
296 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
296 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4232  LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
301 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4858  LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
302 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3508  LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
302 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.581522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5426  LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
302 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967948  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4755  LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
301 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0856  LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
301 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3737  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
298 aa  99  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354722  normal  0.0596552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2275  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.074961  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6042  transcriptional regulator, LuxR family  25.52 
 
 
333 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.184263 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  44.07 
 
 
891 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  37.74 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  24.65 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  24.65 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  39.62 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
219 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0262  two component LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
217 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  21.7 
 
 
234 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3724  response regulator receiver protein  24.89 
 
 
290 aa  42  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.954342  normal  0.199959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>