More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1853 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0527  putative diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 419 aa  844    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1455  putative diaminopimelate decarboxylase  99.76 
 
 		 419 aa  843    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0842  putative diaminopimelate decarboxylase  99.76 
 
 		 419 aa  843    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145845  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1853  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 462 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2095  diaminopimelate decarboxylase, putative  92.15 
 
 		 907 aa  788    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2158  putative diaminopimelate decarboxylase  99.76 
 
 		 419 aa  843    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0431  putative diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 419 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1495  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.8 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  29.87 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  32.56 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  28.28 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  31.89 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  32.25 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  31.77 
 
 		 421 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  26.56 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  28.21 
 
 		 424 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0837  diaminopimelate decarboxylase  31.53 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  29.68 
 
 		 859 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4246  diaminopimelate decarboxylase  31.39 
 
 		 412 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  31.46 
 
 		 421 aa  146  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  31.55 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5403  diaminopimelate decarboxylase  31.3 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3483  diaminopimelate decarboxylase  31.55 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  27.89 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4883  diaminopimelate decarboxylase  31.55 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4771  diaminopimelate decarboxylase  31 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4766  diaminopimelate decarboxylase  32.13 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  31.22 
 
 		 420 aa  143  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  30.35 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  31.22 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  31.2 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  31.2 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  30.96 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  31.2 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  30.27 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  31.2 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  31.2 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  29.88 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  31.2 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  29.18 
 
 		 859 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  32.26 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  31.67 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  28.8 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  29.4 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  30.23 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  29.79 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3181  diaminopimelate decarboxylase  30.88 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3345  diaminopimelate decarboxylase  30.88 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0295344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  30.88 
 
 		 420 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  30.88 
 
 		 420 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  30.64 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.3 
 
 		 868 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  33.09 
 
 		 878 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  32.19 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.18 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1645  diaminopimelate decarboxylase  29.02 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3284  diaminopimelate decarboxylase  31.19 
 
 		 420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7089  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 413 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.5 
 
 		 868 aa  134  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  31.53 
 
 		 433 aa  132  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  26.89 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  29.82 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.64 
 
 		 850 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  30.1 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3625  diaminopimelate decarboxylase  29.14 
 
 		 420 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  25.5 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  27.63 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1136  diaminopimelate decarboxylase  32.84 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  26.89 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  30.17 
 
 		 421 aa  130  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  28.64 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0733  diaminopimelate decarboxylase  28.46 
 
 		 420 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  27.79 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0669  diaminopimelate decarboxylase  32.11 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2916  diaminopimelate decarboxylase  31.94 
 
 		 433 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0948953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3486  diaminopimelate decarboxylase  29.03 
 
 		 420 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.04 
 
 		 864 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0973  diaminopimelate decarboxylase  27.42 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3248  diaminopimelate decarboxylase  27.42 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  31.31 
 
 		 448 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1024  diaminopimelate decarboxylase  27.42 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  30.62 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2740  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3116  diaminopimelate decarboxylase  31.19 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  31.49 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0753  diaminopimelate decarboxylase  28.86 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  29.9 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  33.09 
 
 		 415 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  29.19 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 		 419 aa  123  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  29.81 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  32.29 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  31.55 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  29.08 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  28.08 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  31.08 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  27.41 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  31.98 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>