More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0302 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0867  RemN protein  99.16 
 
 		 558 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1154  hypothetical protein  99.16 
 
 		 243 aa  220  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0302  RemN protein  100 
 
 		 119 aa  219  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  92.63 
 
 		 582 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  92.63 
 
 		 553 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  87.37 
 
 		 587 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  77.91 
 
 		 532 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  77.91 
 
 		 521 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  81.4 
 
 		 523 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  81.4 
 
 		 518 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  80.23 
 
 		 519 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  54.32 
 
 		 511 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  54.12 
 
 		 483 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  50 
 
 		 469 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.12 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  63.83 
 
 		 514 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 510 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  45.74 
 
 		 543 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  48.24 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.33 
 
 		 527 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  52.33 
 
 		 469 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.31 
 
 		 504 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 476 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 476 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 483 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 476 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 483 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 397 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  51.19 
 
 		 476 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.24 
 
 		 478 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50 
 
 		 508 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 574 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.71 
 
 		 452 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 474 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 468 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.35 
 
 		 485 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.56 
 
 		 609 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  51.19 
 
 		 513 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  48.96 
 
 		 480 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 		 494 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 		 516 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3691  putative transmembrane efflux protein  52.94 
 
 		 459 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.67 
 
 		 507 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.91 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  57.65 
 
 		 506 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.22 
 
 		 646 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  43.53 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.22 
 
 		 646 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.4 
 
 		 539 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.57 
 
 		 534 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.22 
 
 		 646 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.67 
 
 		 520 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  48.86 
 
 		 497 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 500 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.37 
 
 		 627 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  44.71 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.18 
 
 		 502 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.13 
 
 		 502 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.51 
 
 		 763 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.58 
 
 		 483 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 497 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.19 
 
 		 490 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  41.86 
 
 		 476 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.02 
 
 		 480 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.74 
 
 		 512 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 491 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 463 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  39.29 
 
 		 498 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 468 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 481 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 512 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 528 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 498 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 494 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  48.75 
 
 		 579 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.81 
 
 		 458 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.19 
 
 		 478 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 505 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.19 
 
 		 494 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 504 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.82 
 
 		 534 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 512 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  52.7 
 
 		 523 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.74 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  40.7 
 
 		 537 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  42.68 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 483 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.68 
 
 		 489 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 512 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 488 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 463 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 512 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 479 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>