48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0062 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  100 
 
 		 239 aa  493  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  99.58 
 
 		 239 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  57.96 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  37.27 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  34.7 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  36.28 
 
 		 234 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  33.18 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  33.18 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  38.71 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  34.42 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  35.51 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  35.91 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  37.38 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  34.72 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  38.42 
 
 		 202 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  35.16 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  34.39 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  34.39 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  34.42 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  32.71 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  35.62 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  30.96 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  33.5 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  34.76 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  32.67 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  31.84 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  29.61 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  31.43 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  30.33 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  31.56 
 
 		 351 aa  95.5  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  32.94 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  33.52 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  27.8 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  27.23 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  27.98 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  28.23 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  29.17 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  27.57 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  28.25 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  29.94 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  29.81 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  32.18 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  28.57 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  28.57 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  26.94 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  27.55 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  26.18 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  29.31 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>