47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6211 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  100 
 
 
244 aa  500  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  33.49 
 
 
231 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  34.52 
 
 
238 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  36.08 
 
 
231 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  34.6 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  34.29 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  33.51 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  34.1 
 
 
223 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  33.14 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  32.37 
 
 
223 aa  72  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  31.31 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  32.02 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  33.04 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  28.88 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  29.5 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  28.57 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  28.57 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  28.57 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  27.4 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  30.93 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  26.6 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  30.62 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  27.37 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  23.68 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  24.35 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  25.39 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  28.14 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  26.24 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  27.18 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  29.34 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  26.46 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  29.7 
 
 
351 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  26.24 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  24.86 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  27.32 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  25.62 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  26.55 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  26.67 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  25 
 
 
237 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  25.49 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  25.12 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  25.12 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  25.14 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  25 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0176  hypothetical protein  21.53 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  23.2 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  25.76 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>