41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0097 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  39.19 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  36.94 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  36.78 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  29.91 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  31.86 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  29 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  29 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  34.43 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  27.96 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  27.06 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  28.74 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  28.11 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  26.36 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  30.39 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  25.45 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  25 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  26.64 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  27.36 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  24.45 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  28.64 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  24.66 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  24.66 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  24.31 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  27.14 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  22.71 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  26.67 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  27.4 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  24.66 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  27.44 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  28.33 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  26.67 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  25.14 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  24.38 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  25.33 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  27.84 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  20.48 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  27.47 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  28.16 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  27.97 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  23.5 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>