45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2652 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  86.32 
 
 		 234 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  90.95 
 
 		 239 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  73.28 
 
 		 248 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  75.45 
 
 		 252 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  68.4 
 
 		 234 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  67.97 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  67.97 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  39.65 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  39.11 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  38.36 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  35.16 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  35.16 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  32.26 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  35.32 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  31.42 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  28.96 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  34.15 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  29.91 
 
 		 351 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  30.23 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  31.6 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  32.02 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  29.52 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  29.58 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  30.85 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  30.35 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  27.91 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  28.4 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  24.39 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  29.3 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  27.83 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  25.91 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  27.36 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  25.47 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  28.7 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  26.83 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  25.15 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  26.59 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  26.29 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  26.27 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  23.94 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  21.32 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  22.22 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2824  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  25 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  24.86 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>