57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4341 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4341  VirB8  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  78.48 
 
 		 223 aa  360  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  75.34 
 
 		 223 aa  359  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  63.51 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  45.07 
 
 		 229 aa  201  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  46.05 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  33.49 
 
 		 231 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  34.4 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  31.67 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  34.42 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  32.71 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  32.71 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  33.49 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  32.23 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  37 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  36 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  32.43 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  34.76 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  32.42 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  36.7 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  35.62 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  28.57 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  29.39 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  27.18 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  26.53 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  29.39 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  32.45 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  33.17 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  32.23 
 
 		 290 aa  88.2  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  32.04 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  26.85 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  28.49 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  26.85 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  30.99 
 
 		 351 aa  78.2  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  32.29 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  30.85 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  28.22 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  31.53 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  29.56 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  29.02 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7350  Type IV secretory pathway component VirB8 protein-like protein  27.95 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.160326 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  28.36 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  26.36 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  27.86 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  27.86 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3815  VirB8  25.73 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.626186  normal  0.202746 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  25.12 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  27.65 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  26.63 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3980  VirB8 family protein  25.73 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0176  hypothetical protein  25.65 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3645  VirB8 family protein  25.73 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0668357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0158  hypothetical protein  24.57 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5235  Type IV secretory pathway component VirB8-like  25.99 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  25.75 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2824  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  28.11 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3200  hypothetical protein  37.11 
 
 		 391 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.958909  normal  0.681183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>