50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a016 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  71.64 
 
 		 220 aa  278  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  54.9 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  38.12 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  38.92 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  38.42 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  35.82 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  36.36 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  36 
 
 		 223 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  35.5 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  33.82 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  33.33 
 
 		 252 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  33.67 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  34.98 
 
 		 228 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  33.33 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  34.67 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  33.99 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  29.5 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  34.17 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  34.17 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  34.17 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  30.92 
 
 		 290 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  33.49 
 
 		 351 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  35.32 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  32.38 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  30.85 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  31.96 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  32.52 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  33.16 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  27.36 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  32.84 
 
 		 240 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  29.33 
 
 		 230 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  30.59 
 
 		 245 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  31.53 
 
 		 228 aa  88.2  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  26.13 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  34.5 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  29.35 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  24.02 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  24 
 
 		 237 aa  72  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  25.63 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  25.95 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  31.14 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  30 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  24.75 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  24.75 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7350  Type IV secretory pathway component VirB8 protein-like protein  21.4 
 
 		 299 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.160326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0176  hypothetical protein  25.94 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0158  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  26.4 
 
 		 225 aa  42  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5235  Type IV secretory pathway component VirB8-like  37.25 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>