31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7530 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  29.91 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  31.16 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  28.93 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  32.08 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  28 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  28 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  28.57 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  26.85 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  23.61 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  28.03 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  29.96 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  27.48 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  27.49 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  24.85 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  27.6 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  24.39 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  26.58 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  29.03 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  28.18 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  28.18 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  28.18 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  23.87 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  26.32 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  25.12 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  23.33 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  23.9 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  24.11 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  26.24 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  28.14 
 
 		 234 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  23.85 
 
 		 231 aa  45.8  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>