41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0004 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  48.51 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  50.7 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  40.71 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  34.63 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  36.05 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  35.06 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  29 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  30.14 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  29.17 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  29.76 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  30.69 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  24.4 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  33.73 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  29.34 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  33.53 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  30.3 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  26.15 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  27.32 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  28.57 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  26.9 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  25.58 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  27.57 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  25.36 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  28.99 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  26.8 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  27.43 
 
 		 351 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  23.44 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  28.06 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  23.72 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  21.65 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  24.14 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  24 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  24.21 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  23.68 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  28.25 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  22.16 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  23 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  23 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  24.28 
 
 		 228 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  22.56 
 
 		 251 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>