85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2345 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1841  conjugal transfer protein TrbF  43.66 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.377716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2353  Conjugal transfer protein  43.5 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.744768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2577  conjugal transfer protein TrbF  40.79 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.756433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1323  conjugal transfer protein TrbF  40.79 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30870  conjugal transfer protein TrbF  40.79 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177985  unclonable  2.25295e-22 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1146  conjugal transfer protein TrbF  44.25 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1902  conjugal transfer protein TrbF  40.79 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.617323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2011  conjugal transfer protein TrbF  40.79 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3548  conjugal transfer protein TrbF  39.04 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2831  conjugal transfer protein TrbF  40.85 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.571124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2692  conjugal transfer protein TrbF  42.11 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0792392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1187  conjugal transfer protein TrbF  39.04 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1348  conjugal transfer protein TrbF  40.35 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000109379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1006  conjugal transfer protein TrbF  39.82 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3699  conjugal transfer protein TrbF  40.35 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2651  conjugal transfer protein TrbF  41.67 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0552472  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35650  conjugal transfer protein TrbF  40.35 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2357  conjugal transfer protein TrbF  40.35 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.109686  normal  0.258524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1289  conjugal transfer protein TrbF  39.91 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0431  conjugal transfer protein TrbF  40.35 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2904  conjugal transfer protein TrbF  41.23 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.071912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1487  conjugal transfer protein TrbF  40.85 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3499  conjugal transfer protein TrbF  41.23 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4201  conjugal transfer protein TrbF  41.12 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.902696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2997  conjugal transfer protein TrbF  38.5 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3993  conjugal transfer protein TrbF  38.5 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0169499  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3371  conjugal transfer protein TrbF  38.94 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3219  conjugal transfer protein TrbF  39.82 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00389999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0602  conjugal transfer protein TrbF  38.5 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0960  conjugal transfer protein TrbF  41.31 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3093  conjugal transfer protein TrbF  37.61 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0733  conjugal transfer protein TrbF  39.04 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3834  conjugal transfer protein TrbF  38.05 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3858  conjugal transfer protein TrbF  36.73 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00683431  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1557  conjugal transfer protein TrbF  39.04 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000776204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3698  conjugal transfer protein TrbF  36.28 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7748  conjugal transfer protein TrbF  38.5 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520847  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7447  conjugal transfer protein TrbF  40.28 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1506  conjugal transfer protein TrbF  38.5 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2093  conjugal transfer protein TrbF  37.61 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0618543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0311  conjugal transfer protein TrbF  37.61 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1713  Conjugal transfer protein  38.74 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000549304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0692  conjugal transfer protein TrbF  38.97 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5369  conjugal transfer protein TrbF  37.55 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682768  normal  0.410714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3534  conjugal transfer protein TrbF  40.09 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776312  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2317  conjugal transfer protein TrbF  37.12 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.643073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2033  conjugal transfer protein TrbF  43.26 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0502  conjugal transfer protein TrbF  37.28 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0478499  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5216  conjugal transfer protein TrbF  40.79 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1477  conjugal transfer protein TrbF  39.44 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0985827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0149  conjugal transfer protein TrbF  38.05 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3201  conjugal transfer protein TrbF  39.44 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2479  conjugal transfer protein TrbF  38.97 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.901597  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3894  conjugal transfer protein TrbF  36.62 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2607  conjugal transfer protein TrbF  34.07 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2885  conjugal transfer protein TrbF  36.28 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0742  conjugal transfer protein TrbF  35.84 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0168  conjugal transfer protein TrbF  34.96 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577326  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2274  conjugal transfer protein TrbF  37.28 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.736535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8326  conjugal transfer protein TrbF  34.26 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029334  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4562  conjugal transfer protein TrbF  32.72 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5383  conjugal transfer protein TrbF  34.55 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9260  conjugal transfer protein TrbF  32.87 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399754  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1665  Conjugal transfer protein  33.48 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5489  conjugal transfer protein TrbF  33.02 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9651  conjugal transfer protein TrbF  33.18 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39699  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6506  conjugal transfer protein TrbF  27.8 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4270  conjugal transfer protein TrbF  28.74 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117817  normal  0.0324718 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6631  conjugal transfer protein TrbF  27.8 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1392  conjugal transfer protein  31.8 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1694  conjugal transfer protein  31.8 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194664  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4695  conjugal transfer protein TrbF  30.84 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0256  conjugal transfer protein  32.26 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2509  conjugal transfer protein  30.05 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2229  conjugal transfer protein TrbF  28.82 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373405  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0051  conjugal transfer protein TrbF  27.15 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4754  hypothetical protein  22.87 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.26139 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0898  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  25.26 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4254  Type IV secretory pathway component VirB8-like  29.07 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1190  hypothetical protein  23.81 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2824  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  22.66 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5235  Type IV secretory pathway component VirB8-like  25.45 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5457  Type IV secretory pathway component VirB8-like  21.37 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0195796 
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  24.29 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>