50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0036 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  71.64 
 
 
202 aa  285  2.9999999999999996e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  58.37 
 
 
225 aa  257  1e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  38.89 
 
 
251 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  39.17 
 
 
239 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  38.71 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  38.81 
 
 
225 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  36.07 
 
 
223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  32.41 
 
 
234 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  34.7 
 
 
234 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  31.67 
 
 
248 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  31.67 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  33.79 
 
 
234 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  33.79 
 
 
234 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  33.18 
 
 
239 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  33.33 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  32.58 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  35.62 
 
 
223 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  32.26 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  36.36 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  32.89 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  33.49 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  30.77 
 
 
215 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  30 
 
 
229 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  31.84 
 
 
231 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  31.63 
 
 
238 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  30.35 
 
 
231 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  33.5 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  35.14 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  31.84 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  31.25 
 
 
351 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  31.63 
 
 
228 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  29.33 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  30.21 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  25.37 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  29.9 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  26.37 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  25.27 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  31.74 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  28.86 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  29.05 
 
 
263 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  29.17 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  23.83 
 
 
283 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0158  hypothetical protein  25.48 
 
 
238 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  21.56 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  24.35 
 
 
244 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5235  Type IV secretory pathway component VirB8-like  25.26 
 
 
243 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587868  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0176  hypothetical protein  24.52 
 
 
238 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7350  Type IV secretory pathway component VirB8 protein-like protein  24 
 
 
299 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.160326 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  24.23 
 
 
237 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>