47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08208 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  100 
 
 		 251 aa  520  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  38.32 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  29.61 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  29.61 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  31.76 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  30.73 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  26.61 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  29.36 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  32.09 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  30.17 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  31.7 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  29.6 
 
 		 283 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  28.57 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  31.78 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  27.72 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  30.84 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  27.4 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  26.07 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  29.09 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  27.93 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  27.52 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  26.13 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  25.37 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  24.64 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  24.23 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  29.27 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  27.01 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  27.01 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  26.07 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  25.75 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  24.42 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  22.17 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  23.53 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  24.48 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  24.55 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  29.58 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  25 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  25 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  25.39 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  24.39 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  24.31 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  24.44 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  23.47 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  24.49 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  24.42 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0158  hypothetical protein  26.17 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7350  Type IV secretory pathway component VirB8 protein-like protein  28.99 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.160326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>