53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6330 on replicon NC_010509
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  57.96 
 
 		 239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  57.96 
 
 		 239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  40.09 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  39.72 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  39.45 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  35.19 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  38.64 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  35.35 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  38.89 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  36.36 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  40.18 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  37.27 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  37.09 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  35.65 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  38.12 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  36.61 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  36.61 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  36.7 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  36.99 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  35.81 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  39.52 
 
 		 215 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  34.42 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  36.63 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  31.19 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  32.58 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  34.26 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  34.09 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  31.22 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  29.29 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  30.73 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  29.22 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  29.91 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  30.6 
 
 		 351 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  29.15 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  35.91 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  30.6 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  30.37 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  31.93 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  31.16 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  30.3 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  33.04 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  26.94 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  26.94 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  27.48 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  30.85 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  27.46 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  28.25 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0176  hypothetical protein  25.22 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4754  hypothetical protein  24.35 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.26139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0158  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5235  Type IV secretory pathway component VirB8-like  26.53 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.96 
 
 		 461 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>