47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_A0027 on replicon NC_011148
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  37.64 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  30.17 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  32.85 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  32.85 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  30.48 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  31.39 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  29.95 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  30.67 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  32.08 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  31.34 
 
 		 223 aa  88.6  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  30.94 
 
 		 223 aa  85.5  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  30.14 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  30.84 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  28.3 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  26.45 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  29.58 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  31.46 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  30.39 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  29.91 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  27.83 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  24.88 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  31.82 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  28.73 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  30 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  29.05 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  27.83 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  27.83 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  26.11 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  27.75 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  28.35 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  26.29 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  27.14 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  25.24 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  27.49 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  25.7 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  26.52 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  25.22 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  28.27 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  24.56 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  25.5 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  27.27 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  25.82 
 
 		 234 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  28.25 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4237  hypothetical protein  25.89 
 
 		 214 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3980  VirB8 family protein  26.98 
 
 		 217 aa  42  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505603  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3815  VirB8  26.51 
 
 		 217 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.626186  normal  0.202746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>