33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0743 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  41.35 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  40 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  40.71 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  32.14 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  28.72 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  27.23 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  30.12 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  31.58 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  29.95 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  27.71 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  30.06 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  26.47 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  32.54 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  27.4 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  24.77 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  28.92 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  28.07 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  24.88 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  23.2 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  26.94 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  26.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  27.46 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  22.54 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  27.98 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  23.47 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  32.19 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  22.55 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  26.87 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  28.15 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  27.17 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0158  hypothetical protein  20.91 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  24.19 
 
 		 227 aa  42  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>