17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pVir0001 on replicon NC_008770
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  100 
 
 
225 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  28.16 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  26.83 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  26.83 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  28.25 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  23.81 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  25.49 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  24.49 
 
 
251 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  27.84 
 
 
263 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  26.18 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  26.18 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  25.91 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  29.59 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3645  VirB8 family protein  26.17 
 
 
218 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0668357 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  24.85 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3980  VirB8 family protein  26.17 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505603  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3815  VirB8  26.17 
 
 
217 aa  45.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.626186  normal  0.202746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>