28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8221 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  71.73 
 
 		 237 aa  355  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  42.41 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  26.17 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  28.32 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  29.87 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  29.22 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  25.78 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  29.79 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  27.19 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  29.08 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  26.04 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  29.41 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  25.35 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  23.18 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  21.27 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  27.43 
 
 		 263 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  28.5 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  28.5 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  22.66 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  23.25 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  26.73 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  29.13 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  28.57 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  26.19 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  28.64 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  26.51 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  24.43 
 
 		 251 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>