More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1951 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1951  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  655    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1146  LysR family transcriptional regulator  56.01 
 
 		 329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.720199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4699  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0119  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2099  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000451168  normal  0.223668 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7793  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0399  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0481  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0676  LysR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0160  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2906  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4684  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0559  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0351204  normal  0.326115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3698  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2229  putative transcriptional regulator  27.09 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.75 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  29.6 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1323  transcriptional regulator, LysR family  30.47 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4905  putative LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00441942  hitchhiker  0.00167298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1236  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.387856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2508  LysR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000736174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5611  transcriptional regulator, LysR family  23.31 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0229  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00000000369009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0237  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  27.37 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4207  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3733  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  26.91 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2074  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0213  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718825  unclonable  0.0000000000104245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4332  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.192569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  23.73 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  27.01 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  26.75 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5230  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  0.114688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2671  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.67 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5878  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4037  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2743  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3047  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  27.94 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10118  oxidative stress response regulatory protein oxyS  26.86 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4028  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1693  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1309  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  27.6 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  23.36 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  24.08 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0897  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  24.26 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0456  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2874  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0140369  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0935  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  24.9 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10390  malonate utilisation transciptional regulator, LysR family  27.64 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0210  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  28.8 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>