115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A1076 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1173  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  99.75 
 
 
393 aa  795    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.760963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1076  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
393 aa  796    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2537  hypothetical protein  40.45 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00283871  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7508  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40 
 
 
384 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0612  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.83 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0049  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.83 
 
 
419 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0270  hypothetical protein  32.02 
 
 
419 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.74 
 
 
419 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3289  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.74 
 
 
419 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1838  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.74 
 
 
419 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0057  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.74 
 
 
419 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0056  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.74 
 
 
419 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2714  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.74 
 
 
419 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.395305  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4455  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.25 
 
 
417 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0616202  normal  0.0186598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 
379 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.81 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  29.6 
 
 
436 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0514  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.53 
 
 
400 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  21.91 
 
 
387 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 
386 aa  53.1  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 
397 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  21.93 
 
 
388 aa  53.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  24.35 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  35.48 
 
 
383 aa  50.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5573  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.57 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1663  extracellular ligand-binding receptor  34.34 
 
 
398 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.596073  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  38.83 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  37.78 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  33.61 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  35.71 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  21.79 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  38.67 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3849  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  26.45 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375619  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  22.7 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0110  putative ABC transporter, substrate-binding protein; putative branched-chain amino acid transporter  31.97 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  24.4 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3265  twin-arginine translocation pathway signal  28.23 
 
 
407 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.77 
 
 
425 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  22.05 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  38.37 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  38.67 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0942  twin-arginine translocation pathway signal  25.07 
 
 
407 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.86 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  35.29 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 
403 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  38.67 
 
 
379 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3427  ABC transporter substrate-binding protein  35.87 
 
 
422 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3122  Extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 
419 aa  46.6  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
339 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 
400 aa  46.6  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  27.1 
 
 
434 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  35.19 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  20.68 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  37.25 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  37.11 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.6 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1953  putative aliphatic amidase expression-regulating protein (amiC)  24.47 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  20.91 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  38.67 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  24.34 
 
 
373 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  36.99 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  23.39 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  29.27 
 
 
840 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  37.35 
 
 
451 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8852  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  36.47 
 
 
448 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132899  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  41.43 
 
 
447 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 
373 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  26.13 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  30.77 
 
 
409 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
415 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  30.93 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>