172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_0235 on replicon NC_011775
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011775  BCG9842_0235  ribosomal protein S1 domain protein  100 
 
 
295 aa  600  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0236  ribosomal protein S1 fragment  37.79 
 
 
303 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0046  hypothetical protein  23.15 
 
 
327 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0077  hypothetical protein  23.29 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0088  hypothetical protein  23.29 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0060  hypothetical protein  23.29 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.135718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
566 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  25.54 
 
 
569 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  25.54 
 
 
569 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  25.14 
 
 
566 aa  57.4  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  24.43 
 
 
570 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
565 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
570 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
570 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
565 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
565 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
565 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
570 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
570 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  25.11 
 
 
547 aa  55.8  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  24.46 
 
 
567 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  24.46 
 
 
566 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  21.99 
 
 
686 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  25.7 
 
 
556 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  25.14 
 
 
582 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  25.7 
 
 
556 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3606  30S ribosomal protein S1  25.68 
 
 
569 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1190  30S ribosomal protein S1  28.07 
 
 
517 aa  53.5  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0920  30S ribosomal protein S1  25.23 
 
 
556 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  24.81 
 
 
558 aa  52.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  24.59 
 
 
567 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  24.59 
 
 
567 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  24.33 
 
 
559 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  26.89 
 
 
558 aa  52.8  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  24.73 
 
 
571 aa  52.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  25.27 
 
 
575 aa  52.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  26.37 
 
 
573 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  23.64 
 
 
575 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1533  30S ribosomal protein S1  25.78 
 
 
391 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.920483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1563  30S ribosomal protein S1  25.78 
 
 
391 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.909441  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0481  30S ribosomal protein S1  28.21 
 
 
557 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_004310  BR0027  30S ribosomal protein S1  24.59 
 
 
566 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.173864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1207  30S ribosomal protein S1  26.32 
 
 
489 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  23.24 
 
 
574 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  25.27 
 
 
558 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1495  30S ribosomal protein S1  24.59 
 
 
570 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  25.27 
 
 
571 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  27.36 
 
 
560 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  23.91 
 
 
569 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0026  30S ribosomal protein S1  24.59 
 
 
566 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0029  30S ribosomal protein S1  24.59 
 
 
566 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  25 
 
 
569 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0194  30S ribosomal protein S1  24.04 
 
 
573 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.571877  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0402  30S ribosomal protein S1  21.77 
 
 
567 aa  50.4  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  25.87 
 
 
561 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  21.48 
 
 
577 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  25.29 
 
 
593 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  24.37 
 
 
556 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  23.16 
 
 
560 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  24.37 
 
 
556 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 
555 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  24.04 
 
 
577 aa  49.3  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  20.92 
 
 
570 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  24.18 
 
 
569 aa  48.9  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  22.18 
 
 
577 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  26.15 
 
 
555 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  22.46 
 
 
558 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  22.46 
 
 
558 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  23.94 
 
 
556 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  23.36 
 
 
562 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  26.85 
 
 
557 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0103  30S ribosomal protein S1  22.53 
 
 
569 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.924927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  23.91 
 
 
571 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  26.38 
 
 
556 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  26.32 
 
 
555 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2073  30S ribosomal protein S1  25.42 
 
 
555 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000721785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  24.09 
 
 
571 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  24.56 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  24.2 
 
 
566 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  24.73 
 
 
558 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02120  30S ribosomal subunit protein S1  25.23 
 
 
504 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000618962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  25.1 
 
 
555 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  23.63 
 
 
566 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  26.13 
 
 
563 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  26.32 
 
 
551 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  26.15 
 
 
555 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  24.04 
 
 
568 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  24.42 
 
 
557 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4092  RNA binding S1 domain protein  25.36 
 
 
681 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000600933  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  24.18 
 
 
561 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  23.66 
 
 
604 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>