234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0236 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0236  ribosomal protein S1 fragment  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0235  ribosomal protein S1 domain protein  37.79 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0920  30S ribosomal protein S1  29.03 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  25 
 
 		 686 aa  59.3  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  27.08 
 
 		 556 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  27.08 
 
 		 556 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  26.57 
 
 		 672 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1233  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  30.63 
 
 		 854 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  28.47 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  28.47 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.06 
 
 		 687 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  24.89 
 
 		 558 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  30 
 
 		 573 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  28.47 
 
 		 556 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  27.74 
 
 		 720 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  28.47 
 
 		 556 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0481  30S ribosomal protein S1  31.62 
 
 		 557 aa  53.1  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  27.15 
 
 		 577 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  26.52 
 
 		 553 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0873  30S ribosomal protein S1  30.69 
 
 		 551 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  23.57 
 
 		 493 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0046  hypothetical protein  24.86 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1709  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 559 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000421469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  27.61 
 
 		 560 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  29.41 
 
 		 539 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  28.47 
 
 		 557 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  29.37 
 
 		 608 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  29.71 
 
 		 654 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02120  30S ribosomal subunit protein S1  28.66 
 
 		 504 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000618962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1430  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00086358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  27.62 
 
 		 556 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2339  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 569 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00489204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2237  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000585516  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  28.14 
 
 		 563 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0077  hypothetical protein  23.26 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4092  RNA binding S1 domain protein  25.56 
 
 		 681 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000600933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  24.73 
 
 		 385 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  26.4 
 
 		 705 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3013  30S ribosomal protein S1  27.08 
 
 		 556 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000348916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  28.12 
 
 		 560 aa  49.7  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0088  hypothetical protein  23.26 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  26.11 
 
 		 811 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0060  hypothetical protein  23.26 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.135718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  24.24 
 
 		 609 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2517  RNA binding S1 domain protein  23.64 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000225878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1337  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.92 
 
 		 543 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000610744  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0255  30S ribosomal protein S1  23.76 
 
 		 558 aa  49.3  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0579142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  26.95 
 
 		 694 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  30.3 
 
 		 598 aa  49.3  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  23.32 
 
 		 593 aa  49.3  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  25.55 
 
 		 500 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  28.24 
 
 		 599 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  25.32 
 
 		 485 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1207  30S ribosomal protein S1  27.62 
 
 		 489 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  25.12 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  25 
 
 		 736 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  24.29 
 
 		 491 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  25.55 
 
 		 480 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  28.87 
 
 		 529 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  26.11 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  26.81 
 
 		 678 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  24.09 
 
 		 493 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  25.12 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  28.47 
 
 		 556 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  26.9 
 
 		 573 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2668  30S ribosomal protein S1  27.08 
 
 		 557 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  24.64 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  29.63 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0514  30S ribosomal protein S1  33.05 
 
 		 557 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2003  30S ribosomal protein S1  27.08 
 
 		 565 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0183924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2580  30S ribosomal protein S1  27.08 
 
 		 557 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000500826  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  24.82 
 
 		 619 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1955  30S ribosomal protein S1  27.08 
 
 		 557 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132161  normal  0.358522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1735  30S ribosomal protein S1  27.08 
 
 		 557 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  26.34 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  24.26 
 
 		 492 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  24.05 
 
 		 492 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  24.31 
 
 		 555 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  24.82 
 
 		 493 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  26.78 
 
 		 561 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  25.15 
 
 		 560 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  27.85 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  24.31 
 
 		 551 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  24.82 
 
 		 487 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  26.99 
 
 		 559 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  25.55 
 
 		 557 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>