More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0126 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0126  RNA polymerase factor sigma-32  100 
 
 
303 aa  615  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1701  RNA polymerase factor sigma-32  63.77 
 
 
311 aa  367  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000437901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1137  RNA polymerase factor sigma-32  64.13 
 
 
311 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1763  RNA polymerase factor sigma-32  63.77 
 
 
311 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00750009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3813  RNA polymerase factor sigma-32  62.99 
 
 
287 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.674997  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4142  RNA polymerase factor sigma-32  63.35 
 
 
287 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000322567  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4270  RNA polymerase factor sigma-32  61.82 
 
 
285 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4806  RNA polymerase factor sigma-32  62.08 
 
 
293 aa  342  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0484047  hitchhiker  0.000291044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1717  RNA polymerase factor sigma-32  61.34 
 
 
293 aa  338  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3380  RNA polymerase factor sigma-32  57.76 
 
 
284 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000950238  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3111  RNA polymerase factor sigma-32  61.34 
 
 
288 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3709  RNA polymerase factor sigma-32  60.59 
 
 
291 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.126139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4338  RNA polymerase factor sigma-32  59.85 
 
 
290 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239407  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3881  RNA polymerase factor sigma-32  60.22 
 
 
290 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4191  RNA polymerase factor sigma-32  60.22 
 
 
290 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal  0.154969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1693  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  55.11 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.199349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2297  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  53.18 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000241193  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2978  RNA polymerase factor sigma-32  47.72 
 
 
293 aa  257  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2254  RNA polymerase factor sigma-32  48.2 
 
 
292 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.142039  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0601  RNA polymerase factor sigma-32  48.2 
 
 
292 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0482  RNA polymerase factor sigma-32  48.2 
 
 
292 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0456  RNA polymerase factor sigma-32  47.96 
 
 
292 aa  252  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369824  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0906  RNA polymerase factor sigma-32  46.13 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2159  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  44.4 
 
 
340 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5640  RNA polymerase factor sigma-32  44.4 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190332  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0474  RNA polymerase factor sigma-32  44.79 
 
 
295 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  hitchhiker  0.00148932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6847  RNA polymerase factor sigma-32  44.02 
 
 
296 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7583  RNA polymerase factor sigma-32  44.02 
 
 
296 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00673582  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0942  RNA polymerase factor sigma-32  43.63 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.784725  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0060  RNA polymerase factor sigma-32  44.4 
 
 
301 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0322341  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0964  RNA polymerase factor sigma-32  43.63 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3045  RNA polymerase factor sigma-32  44.19 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1001  RNA polymerase factor sigma-32  43.63 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1110  RNA polymerase factor sigma-32  44.96 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0371  RNA polymerase factor sigma-32  43.63 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.532177  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0584  RNA polymerase factor sigma-32  40.89 
 
 
295 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114197  hitchhiker  0.000584555 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0287  RNA polymerase factor sigma-32  43.01 
 
 
303 aa  209  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1021  RNA polymerase factor sigma-32  43.85 
 
 
306 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000226407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0455  RNA polymerase factor sigma-32  42.86 
 
 
299 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.676672  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0360  RNA polymerase factor sigma-32  42.86 
 
 
299 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000866831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2860  RNA polymerase factor sigma-32  41.98 
 
 
299 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2307  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  43.24 
 
 
303 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00328793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0662  RNA polymerase factor sigma-32  40.73 
 
 
295 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0605  RNA polymerase factor sigma-32  42.47 
 
 
299 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1743  RNA polymerase factor sigma-32  42.8 
 
 
300 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0213426  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6760  RNA polymerase factor sigma-32  42.47 
 
 
299 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209002  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1986  RNA polymerase factor sigma-32  42.69 
 
 
300 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.134117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2614  RNA polymerase factor sigma-32  43.54 
 
 
301 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0347  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  43.63 
 
 
299 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3156  RNA polymerase factor sigma-32  41.7 
 
 
308 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00251516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3087  RNA polymerase factor sigma-32  44.44 
 
 
302 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341195  normal  0.142268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3344  RNA polymerase factor sigma-32  44.44 
 
 
302 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2718  RNA polymerase factor sigma-32  40.64 
 
 
296 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3538  RNA polymerase factor sigma-32  44.23 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0192521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2609  RNA polymerase factor sigma-32  41.79 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1073  RNA polymerase factor sigma-32  42.02 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.293042  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2410  RNA polymerase factor sigma-32  42.02 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1236  RNA polymerase factor sigma-32  41.88 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1650  RNA polymerase factor sigma-32  42.75 
 
 
303 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2430  RNA polymerase factor sigma-32  40.6 
 
 
299 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0283677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0563  RNA polymerase factor sigma-32  40.15 
 
 
299 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.939582  normal  0.0697509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3400  RNA polymerase factor sigma-32  39.92 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1572  RNA polymerase factor sigma-32  41.63 
 
 
298 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.013476  normal  0.683466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1597  RNA polymerase factor sigma-32  42.38 
 
 
303 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2216  RNA polymerase factor sigma-32  41.86 
 
 
301 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239761  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2323  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  40.31 
 
 
290 aa  192  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000107256  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2382  RNA polymerase, sigma (32) factor  39.31 
 
 
286 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.21763e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1062  RNA polymerase factor sigma-32  38.99 
 
 
283 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3542  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  38.24 
 
 
313 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2302  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  37.83 
 
 
287 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.962406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3837  RNA polymerase factor sigma-32  38.29 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265332  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0197  sigma 32 (RpoH)  40.3 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2741  RNA polymerase factor sigma-32  37.96 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2662  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  36.09 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148114 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0341  RNA polymerase sigma-32 factor  36.47 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1694  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  37.59 
 
 
314 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0655  RNA polymerase sigma-32 factor  37.78 
 
 
297 aa  172  9e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0381956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0345  sigma-70 factor  37.92 
 
 
281 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.79091  normal  0.0122375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3894  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  37 
 
 
313 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1064  heat shock sigma factor RpoH  34.87 
 
 
297 aa  170  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0283902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1525  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  38.6 
 
 
326 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1108  RNA polymerase sigma-70  35.94 
 
 
299 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0489202  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0325  RNA polymerase factor sigma-32  35.56 
 
 
309 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1848  RNA polymerase sigma factor RpoH  35.66 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370084  normal  0.912724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0249  RNA polymerase factor sigma-32  35 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0230  RNA polymerase factor sigma-32  35 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0385  sigma-70 region 2:sigma-70 region 4  36.84 
 
 
300 aa  166  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.58272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0374  RNA polymerase factor sigma-32  35.71 
 
 
306 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.391616  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0702  sigma 32 (RpoH)  36.36 
 
 
285 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179676  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3666  RNA polymerase factor sigma-32  35.03 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3171  RNA polymerase sigma-32 factor  36.82 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171654  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3522  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  37.27 
 
 
321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0858  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  38.55 
 
 
350 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000347952  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4379  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  35 
 
 
313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0272  RNA polymerase factor sigma-32  35.71 
 
 
311 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0486  RNA polymerase factor sigma-32  35 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2845  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  36.9 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4476  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  35.77 
 
 
313 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1972  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  34.43 
 
 
307 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1991  RNA polymerase sigma factor RpoH  34.43 
 
 
307 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>