More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1064 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1064  heat shock sigma factor RpoH  100 
 
 
297 aa  614  1e-175  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0283902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0385  sigma-70 region 2:sigma-70 region 4  56.84 
 
 
300 aa  321  9.000000000000001e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.58272  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0655  RNA polymerase sigma-32 factor  54.93 
 
 
297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0381956  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2718  RNA polymerase factor sigma-32  45.32 
 
 
296 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0474  RNA polymerase factor sigma-32  44.68 
 
 
295 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  hitchhiker  0.00148932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1021  RNA polymerase factor sigma-32  45.52 
 
 
306 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000226407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2159  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  43.73 
 
 
340 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0287  RNA polymerase factor sigma-32  44.4 
 
 
303 aa  256  3e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1110  RNA polymerase factor sigma-32  42.36 
 
 
299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0662  RNA polymerase factor sigma-32  41.58 
 
 
295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0563  RNA polymerase factor sigma-32  42.71 
 
 
299 aa  251  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.939582  normal  0.0697509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0360  RNA polymerase factor sigma-32  43.4 
 
 
299 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000866831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0371  RNA polymerase factor sigma-32  43.93 
 
 
299 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.532177  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3156  RNA polymerase factor sigma-32  44.29 
 
 
308 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00251516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0584  RNA polymerase factor sigma-32  41.69 
 
 
295 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114197  hitchhiker  0.000584555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0060  RNA polymerase factor sigma-32  44.77 
 
 
301 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0322341  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0455  RNA polymerase factor sigma-32  43.06 
 
 
299 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.676672  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6847  RNA polymerase factor sigma-32  45.42 
 
 
296 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6760  RNA polymerase factor sigma-32  43.75 
 
 
299 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209002  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7583  RNA polymerase factor sigma-32  44.1 
 
 
296 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00673582  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1986  RNA polymerase factor sigma-32  45.22 
 
 
300 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.134117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2614  RNA polymerase factor sigma-32  44.96 
 
 
301 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3400  RNA polymerase factor sigma-32  41.41 
 
 
298 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3538  RNA polymerase factor sigma-32  44.24 
 
 
300 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0192521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1572  RNA polymerase factor sigma-32  43.11 
 
 
298 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.013476  normal  0.683466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5640  RNA polymerase factor sigma-32  44.69 
 
 
297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190332  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2609  RNA polymerase factor sigma-32  42.76 
 
 
298 aa  245  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0605  RNA polymerase factor sigma-32  42.36 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1650  RNA polymerase factor sigma-32  44.24 
 
 
303 aa  245  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0113806  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3344  RNA polymerase factor sigma-32  44.44 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1236  RNA polymerase factor sigma-32  43.88 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1743  RNA polymerase factor sigma-32  42.29 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0213426  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1597  RNA polymerase factor sigma-32  44.24 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3045  RNA polymerase factor sigma-32  42.31 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0942  RNA polymerase factor sigma-32  44.32 
 
 
297 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.784725  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1073  RNA polymerase factor sigma-32  43.87 
 
 
298 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.293042  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2410  RNA polymerase factor sigma-32  43.87 
 
 
298 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3087  RNA polymerase factor sigma-32  44.4 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341195  normal  0.142268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2307  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  43.01 
 
 
303 aa  242  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00328793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1001  RNA polymerase factor sigma-32  44.32 
 
 
297 aa  242  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0964  RNA polymerase factor sigma-32  44.32 
 
 
297 aa  242  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2860  RNA polymerase factor sigma-32  42.5 
 
 
299 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0341  RNA polymerase sigma-32 factor  40.75 
 
 
288 aa  239  4e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2430  RNA polymerase factor sigma-32  42.01 
 
 
299 aa  235  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0283677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2216  RNA polymerase factor sigma-32  40.54 
 
 
301 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239761  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0347  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  40.97 
 
 
299 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2382  RNA polymerase, sigma (32) factor  41.81 
 
 
286 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.21763e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2323  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  40.79 
 
 
290 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000107256  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1887  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  38.99 
 
 
307 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1972  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  38.99 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0345  sigma-70 factor  39.59 
 
 
281 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.79091  normal  0.0122375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1848  RNA polymerase sigma factor RpoH  38.19 
 
 
307 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370084  normal  0.912724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1991  RNA polymerase sigma factor RpoH  38.63 
 
 
307 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0655  RNA polymerase sigma-32 factor  41.91 
 
 
284 aa  208  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00800994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1108  RNA polymerase sigma-70  37.88 
 
 
299 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0489202  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3603  RNA polymerase factor sigma-32  40.07 
 
 
285 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000309877  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0059  alternative sigma factor RpoH  37.07 
 
 
286 aa  205  8e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.314637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0197  sigma 32 (RpoH)  40.53 
 
 
329 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0114  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  39.08 
 
 
292 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00356807  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2900  RNA polymerase factor sigma-32  38.14 
 
 
286 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0400312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1693  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  37.17 
 
 
298 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.199349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0210  RNA polymerase factor sigma-32  40.94 
 
 
288 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000219279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3743  RNA polymerase factor sigma-32  40.96 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4981  RNA polymerase factor sigma-32  39.13 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5108  RNA polymerase factor sigma-32  39.13 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.149866  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03532  RNA polymerase sigma factor  39.5 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3465  RNA polymerase factor sigma-32  38.05 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36661  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2721  RNA polymerase factor sigma-32  38.59 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03711  RNA polymerase factor sigma-32  40.62 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4806  RNA polymerase factor sigma-32  38.18 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0484047  hitchhiker  0.000291044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1069  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  37.24 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0357  RNA polymerase factor sigma-32  39.13 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5158  RNA polymerase factor sigma-32  39.42 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900853  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1717  RNA polymerase factor sigma-32  38.18 
 
 
293 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2594  RNA polymerase factor sigma-32  38.28 
 
 
284 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1128  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  36.9 
 
 
300 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1197  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  37.46 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3950  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  40.44 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3770  RNA polymerase factor sigma-32  38.51 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2113  RNA polymerase factor sigma-32  40.58 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.199726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3760  RNA polymerase factor sigma-32  38.18 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3837  RNA polymerase factor sigma-32  38.51 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3939  RNA polymerase factor sigma-32  38.51 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3880  RNA polymerase factor sigma-32  38.51 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0292  RNA polymerase factor sigma-32  38.72 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000107182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03310  RNA polymerase sigma factor  38.18 
 
 
284 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0254  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  38.18 
 
 
284 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3861  RNA polymerase factor sigma-32  38.18 
 
 
284 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3660  RNA polymerase factor sigma-32  38.18 
 
 
284 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3744  RNA polymerase factor sigma-32  38.18 
 
 
284 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0255  RNA polymerase factor sigma-32  38.18 
 
 
284 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03263  hypothetical protein  38.18 
 
 
284 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3977  RNA polymerase factor sigma-32  39.24 
 
 
285 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000239264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00277  RNA polymerase factor sigma-32  41.2 
 
 
285 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4781  RNA polymerase factor sigma-32  38.18 
 
 
284 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3943  RNA polymerase factor sigma-32  38.18 
 
 
284 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0181  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  39.3 
 
 
280 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3874  RNA polymerase factor sigma-32  37.76 
 
 
285 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1062  RNA polymerase factor sigma-32  40 
 
 
283 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0204  RNA polymerase factor sigma-32  37.93 
 
 
283 aa  198  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000789244  decreased coverage  0.00000216818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>