More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0385 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0385  sigma-70 region 2:sigma-70 region 4  100 
 
 		 300 aa  616  1e-175  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.58272  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0655  RNA polymerase sigma-32 factor  89.69 
 
 		 297 aa  540  1e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0381956  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1064  heat shock sigma factor RpoH  56.84 
 
 		 297 aa  321  9.000000000000001e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0283902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2718  RNA polymerase factor sigma-32  48.73 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2216  RNA polymerase factor sigma-32  44.82 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3538  RNA polymerase factor sigma-32  47.2 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0192521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0060  RNA polymerase factor sigma-32  49.64 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0322341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2159  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  48.54 
 
 		 340 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1572  RNA polymerase factor sigma-32  45.99 
 
 		 298 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.013476  normal  0.683466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0474  RNA polymerase factor sigma-32  46.98 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  hitchhiker  0.00148932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1986  RNA polymerase factor sigma-32  47.84 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.134117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1073  RNA polymerase factor sigma-32  44.95 
 
 		 298 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.293042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2410  RNA polymerase factor sigma-32  44.95 
 
 		 298 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6847  RNA polymerase factor sigma-32  46.55 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1110  RNA polymerase factor sigma-32  47.81 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0563  RNA polymerase factor sigma-32  44.95 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.939582  normal  0.0697509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7583  RNA polymerase factor sigma-32  46.55 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00673582  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1021  RNA polymerase factor sigma-32  48.18 
 
 		 306 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000226407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0371  RNA polymerase factor sigma-32  47.45 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.532177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2609  RNA polymerase factor sigma-32  43.67 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3087  RNA polymerase factor sigma-32  45.21 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341195  normal  0.142268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3344  RNA polymerase factor sigma-32  45.73 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1236  RNA polymerase factor sigma-32  49.06 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1650  RNA polymerase factor sigma-32  49.06 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3045  RNA polymerase factor sigma-32  49.45 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3400  RNA polymerase factor sigma-32  43.33 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0605  RNA polymerase factor sigma-32  46.5 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1743  RNA polymerase factor sigma-32  48.18 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0213426  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5640  RNA polymerase factor sigma-32  46.21 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190332  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0455  RNA polymerase factor sigma-32  47.08 
 
 		 299 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.676672  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2860  RNA polymerase factor sigma-32  47.45 
 
 		 299 aa  258  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1597  RNA polymerase factor sigma-32  48.68 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0347  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  46.21 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1001  RNA polymerase factor sigma-32  45.17 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6760  RNA polymerase factor sigma-32  45.8 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0360  RNA polymerase factor sigma-32  46.72 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000866831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0964  RNA polymerase factor sigma-32  45.17 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2430  RNA polymerase factor sigma-32  47.45 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0283677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0942  RNA polymerase factor sigma-32  45.17 
 
 		 297 aa  255  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.784725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3156  RNA polymerase factor sigma-32  46.79 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00251516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2307  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  44.48 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00328793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0662  RNA polymerase factor sigma-32  45.58 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2614  RNA polymerase factor sigma-32  46.04 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0287  RNA polymerase factor sigma-32  47.79 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0584  RNA polymerase factor sigma-32  43.51 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114197  hitchhiker  0.000584555 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0341  RNA polymerase sigma-32 factor  41.52 
 
 		 288 aa  229  6e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1330  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  41.99 
 
 		 285 aa  222  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000387324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0655  RNA polymerase sigma-32 factor  41.43 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00800994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2323  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  41.54 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000107256  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3950  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  42.28 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2382  RNA polymerase, sigma (32) factor  39.57 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.21763e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1693  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  39.1 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2854  sigma 32 (RpoH)  40.22 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000132969  hitchhiker  0.0000000816438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1848  RNA polymerase sigma factor RpoH  40.79 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370084  normal  0.912724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0181  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  42.46 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0586  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  41.33 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00166054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0570  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  41.45 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0573  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  40.22 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000689788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0197  sigma 32 (RpoH)  40.82 
 
 		 329 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1887  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  39.64 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1972  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  39.64 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0207  RNA polymerase factor sigma-32  39.15 
 
 		 341 aa  199  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00507389  hitchhiker  0.000595744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0227  RNA polymerase factor sigma-32  39.15 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0140317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0114  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  41.13 
 
 		 292 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00356807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1991  RNA polymerase sigma factor RpoH  39.64 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0356  RNA polymerase factor sigma-32  40.36 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000321506  hitchhiker  0.000547654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00277  RNA polymerase factor sigma-32  39.27 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0430  RNA polymerase sigma-32 factor  40.36 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4748  RNA polymerase factor sigma-32  40.36 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294089  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2741  RNA polymerase factor sigma-32  41.13 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03532  RNA polymerase sigma factor  39.62 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3465  RNA polymerase factor sigma-32  39.11 
 
 		 285 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0664  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  39.86 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000163215  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1525  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  37.76 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2371  RNA polymerase factor sigma-32  37.93 
 
 		 286 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115405  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1069  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  36.81 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1062  RNA polymerase factor sigma-32  40.66 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1128  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  36.81 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1197  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  36.81 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1108  RNA polymerase sigma-70  36.36 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0489202  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2986  RNA polymerase factor sigma-32  40.22 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0272  RNA polymerase factor sigma-32  41.05 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0325  RNA polymerase factor sigma-32  41.05 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3770  RNA polymerase factor sigma-32  38.75 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3939  RNA polymerase factor sigma-32  38.75 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3837  RNA polymerase factor sigma-32  38.75 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3880  RNA polymerase factor sigma-32  38.75 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5158  RNA polymerase factor sigma-32  39.13 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3380  RNA polymerase factor sigma-32  38.81 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000950238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002141  RNA polymerase sigma factor RpoH  38.1 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000181562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03310  RNA polymerase sigma factor  38.38 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0254  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  38.38 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4781  RNA polymerase factor sigma-32  38.38 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0374  RNA polymerase factor sigma-32  40.28 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.391616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3943  RNA polymerase factor sigma-32  38.38 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3744  RNA polymerase factor sigma-32  38.38 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0255  RNA polymerase factor sigma-32  38.38 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3660  RNA polymerase factor sigma-32  38.38 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03263  hypothetical protein  38.38 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3861  RNA polymerase factor sigma-32  38.38 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>