More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0287 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0287  RNA polymerase factor sigma-32  100 
 
 
303 aa  622  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1236  RNA polymerase factor sigma-32  80.58 
 
 
303 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1650  RNA polymerase factor sigma-32  79.86 
 
 
303 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1597  RNA polymerase factor sigma-32  79.5 
 
 
303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3156  RNA polymerase factor sigma-32  76.55 
 
 
308 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00251516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2614  RNA polymerase factor sigma-32  73.13 
 
 
301 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3538  RNA polymerase factor sigma-32  72.45 
 
 
300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0192521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3344  RNA polymerase factor sigma-32  70.75 
 
 
302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3087  RNA polymerase factor sigma-32  70.41 
 
 
302 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341195  normal  0.142268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7583  RNA polymerase factor sigma-32  68.73 
 
 
296 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00673582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0371  RNA polymerase factor sigma-32  66.89 
 
 
299 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.532177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6847  RNA polymerase factor sigma-32  69.07 
 
 
296 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2430  RNA polymerase factor sigma-32  65.99 
 
 
299 aa  411  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0283677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0605  RNA polymerase factor sigma-32  65 
 
 
299 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0360  RNA polymerase factor sigma-32  65.32 
 
 
299 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000866831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2860  RNA polymerase factor sigma-32  65.67 
 
 
299 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1986  RNA polymerase factor sigma-32  69.72 
 
 
300 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.134117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0455  RNA polymerase factor sigma-32  64.65 
 
 
299 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.676672  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6760  RNA polymerase factor sigma-32  64.21 
 
 
299 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209002  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5640  RNA polymerase factor sigma-32  68.33 
 
 
297 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190332  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2159  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  70.44 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0347  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  68.2 
 
 
299 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2307  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  67.14 
 
 
303 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00328793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0942  RNA polymerase factor sigma-32  66.9 
 
 
297 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.784725  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0964  RNA polymerase factor sigma-32  66.9 
 
 
297 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1001  RNA polymerase factor sigma-32  66.9 
 
 
297 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0584  RNA polymerase factor sigma-32  66.31 
 
 
295 aa  374  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114197  hitchhiker  0.000584555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0662  RNA polymerase factor sigma-32  62.41 
 
 
295 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0563  RNA polymerase factor sigma-32  63.03 
 
 
299 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.939582  normal  0.0697509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1572  RNA polymerase factor sigma-32  63.16 
 
 
298 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.013476  normal  0.683466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2410  RNA polymerase factor sigma-32  62.41 
 
 
298 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1073  RNA polymerase factor sigma-32  62.41 
 
 
298 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.293042  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2718  RNA polymerase factor sigma-32  60.34 
 
 
296 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0474  RNA polymerase factor sigma-32  62.5 
 
 
295 aa  363  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  hitchhiker  0.00148932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2216  RNA polymerase factor sigma-32  62.46 
 
 
301 aa  363  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239761  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1110  RNA polymerase factor sigma-32  60.42 
 
 
299 aa  362  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3400  RNA polymerase factor sigma-32  60 
 
 
298 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2609  RNA polymerase factor sigma-32  63.16 
 
 
298 aa  358  6e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1743  RNA polymerase factor sigma-32  61.35 
 
 
300 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0213426  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0060  RNA polymerase factor sigma-32  62.41 
 
 
301 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0322341  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3045  RNA polymerase factor sigma-32  57.39 
 
 
299 aa  345  5e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1021  RNA polymerase factor sigma-32  57.82 
 
 
306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000226407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0197  sigma 32 (RpoH)  46.74 
 
 
329 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_002978  WD1064  heat shock sigma factor RpoH  44.4 
 
 
297 aa  256  3e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0283902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1525  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  46.82 
 
 
326 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0655  RNA polymerase sigma-32 factor  46.69 
 
 
297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0381956  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0385  sigma-70 region 2:sigma-70 region 4  47.79 
 
 
300 aa  252  6e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.58272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2323  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  48.01 
 
 
290 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000107256  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2854  sigma 32 (RpoH)  44.48 
 
 
279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000132969  hitchhiker  0.0000000816438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2382  RNA polymerase, sigma (32) factor  45.67 
 
 
286 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.21763e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0655  RNA polymerase sigma-32 factor  45.2 
 
 
284 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00800994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4270  RNA polymerase factor sigma-32  49.81 
 
 
285 aa  235  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1330  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  43.49 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000387324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0570  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  44.48 
 
 
291 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1693  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  43.16 
 
 
298 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.199349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3950  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  44.93 
 
 
280 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1763  RNA polymerase factor sigma-32  43.26 
 
 
311 aa  228  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00750009  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1701  RNA polymerase factor sigma-32  43.26 
 
 
311 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000437901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4806  RNA polymerase factor sigma-32  45.31 
 
 
293 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0484047  hitchhiker  0.000291044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2297  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  41.67 
 
 
305 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000241193  normal  0.392536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3837  RNA polymerase factor sigma-32  45.36 
 
 
286 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265332  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1848  RNA polymerase sigma factor RpoH  42.46 
 
 
307 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370084  normal  0.912724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1717  RNA polymerase factor sigma-32  43.88 
 
 
293 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0664  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  44.93 
 
 
282 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000163215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4142  RNA polymerase factor sigma-32  46.54 
 
 
287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000322567  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0114  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  44.77 
 
 
292 aa  225  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00356807  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0341  RNA polymerase sigma-32 factor  45.3 
 
 
288 aa  225  8e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1972  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  42.12 
 
 
307 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1991  RNA polymerase sigma factor RpoH  42.03 
 
 
307 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1137  RNA polymerase factor sigma-32  43.26 
 
 
311 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3813  RNA polymerase factor sigma-32  46.54 
 
 
287 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.674997  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0702  sigma 32 (RpoH)  44.25 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179676  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1887  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  42.12 
 
 
307 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0181  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  43.77 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3111  RNA polymerase factor sigma-32  43.32 
 
 
288 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2741  RNA polymerase factor sigma-32  43.9 
 
 
281 aa  220  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3380  RNA polymerase factor sigma-32  43.75 
 
 
284 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000950238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1062  RNA polymerase factor sigma-32  44.29 
 
 
283 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0207  RNA polymerase factor sigma-32  43.06 
 
 
341 aa  216  5e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00507389  hitchhiker  0.000595744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4379  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  41.13 
 
 
313 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202105  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0227  RNA polymerase factor sigma-32  43.06 
 
 
287 aa  215  8e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0140317  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0356  RNA polymerase factor sigma-32  43.42 
 
 
372 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000321506  hitchhiker  0.000547654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03711  RNA polymerase factor sigma-32  42.7 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0345  sigma-70 factor  42.36 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.79091  normal  0.0122375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0204  RNA polymerase factor sigma-32  40.36 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000789244  decreased coverage  0.00000216818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00277  RNA polymerase factor sigma-32  41.2 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3666  RNA polymerase factor sigma-32  41.73 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3465  RNA polymerase factor sigma-32  41.2 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36661  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0222  RNA polymerase factor sigma-32  40 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0573  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  41.75 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000689788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3709  RNA polymerase factor sigma-32  46.09 
 
 
291 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.126139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002141  RNA polymerase sigma factor RpoH  41.96 
 
 
285 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000181562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3603  RNA polymerase factor sigma-32  39.78 
 
 
285 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000309877  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2978  RNA polymerase factor sigma-32  43.85 
 
 
293 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3977  RNA polymerase factor sigma-32  39.43 
 
 
285 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000239264  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1545  RNA polymerase factor sigma-32  41.39 
 
 
280 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.197254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4476  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  40.14 
 
 
313 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0301  RNA polymerase factor sigma-32  42.51 
 
 
311 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0586  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  41.07 
 
 
285 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00166054 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0126  RNA polymerase factor sigma-32  43.01 
 
 
303 aa  209  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>