More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2708 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2708  peptide chain release factor 2  100 
 
 
309 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215879  normal  0.913417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  85.76 
 
 
372 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2901  peptide chain release factor 2  86.41 
 
 
309 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2716  peptide chain release factor 2  86.73 
 
 
309 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  60.07 
 
 
372 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  58.67 
 
 
317 aa  362  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  60.07 
 
 
364 aa  361  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  57.97 
 
 
371 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  57.43 
 
 
372 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  58.28 
 
 
322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  55.48 
 
 
326 aa  334  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  56.95 
 
 
340 aa  333  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  58.76 
 
 
361 aa  333  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  56.46 
 
 
376 aa  332  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  55.93 
 
 
321 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  57.63 
 
 
322 aa  328  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  52.7 
 
 
312 aa  328  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  55.59 
 
 
375 aa  328  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  55.7 
 
 
378 aa  326  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  53.22 
 
 
332 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  51.16 
 
 
369 aa  326  3e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  57.49 
 
 
325 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  54.49 
 
 
367 aa  324  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  51.54 
 
 
362 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  55.78 
 
 
321 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  51.5 
 
 
357 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  54.05 
 
 
367 aa  323  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  56.29 
 
 
376 aa  323  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  51.19 
 
 
364 aa  322  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  55.44 
 
 
321 aa  322  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  55.44 
 
 
321 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  51.51 
 
 
329 aa  322  6e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  56.69 
 
 
379 aa  322  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  60.8 
 
 
369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  53.21 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  50.67 
 
 
371 aa  318  6e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  55.93 
 
 
321 aa  318  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  53.74 
 
 
341 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 
366 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  54.24 
 
 
344 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  54.92 
 
 
322 aa  316  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  51 
 
 
372 aa  316  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  56.52 
 
 
343 aa  315  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  54.48 
 
 
310 aa  315  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  56.8 
 
 
322 aa  315  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  51.01 
 
 
364 aa  314  9e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  49.83 
 
 
373 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  49.83 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  54.28 
 
 
374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  51.18 
 
 
366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  49.66 
 
 
369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  49.66 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  53.9 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  52.46 
 
 
372 aa  312  4.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  55.69 
 
 
362 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  55.75 
 
 
349 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  54.11 
 
 
323 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  53.77 
 
 
322 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  53.61 
 
 
375 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  52.33 
 
 
330 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  53.26 
 
 
321 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  51.19 
 
 
375 aa  310  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  51.86 
 
 
368 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  56.01 
 
 
342 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  52.35 
 
 
366 aa  309  5e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  55.51 
 
 
369 aa  308  9e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  48.99 
 
 
371 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  52.54 
 
 
369 aa  307  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  55.05 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  49.33 
 
 
365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  49.5 
 
 
367 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  54.79 
 
 
329 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  50 
 
 
374 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  56.14 
 
 
375 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  52.05 
 
 
383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39400  peptide chain release factor 2  56.32 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  55.24 
 
 
367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  54.2 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  53.42 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  54.3 
 
 
376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  52.1 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  51.54 
 
 
330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  51.45 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  52.54 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  51.37 
 
 
370 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  54.01 
 
 
378 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  53.04 
 
 
302 aa  302  6.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  47.47 
 
 
380 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  51.54 
 
 
377 aa  301  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  51.17 
 
 
369 aa  301  7.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  47.14 
 
 
380 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  52.23 
 
 
365 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  52.32 
 
 
332 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  52.23 
 
 
365 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  52.23 
 
 
365 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  52.23 
 
 
365 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  52.74 
 
 
364 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  52.23 
 
 
365 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  47.14 
 
 
380 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  50 
 
 
366 aa  300  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>