More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2716 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2716  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 309 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2901  peptide chain release factor 2  98.38 
 
 		 309 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  97.73 
 
 		 372 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2708  peptide chain release factor 2  86.73 
 
 		 309 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215879  normal  0.913417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  60.6 
 
 		 372 aa  371  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 317 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 364 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  58.64 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  57.43 
 
 		 372 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  60.34 
 
 		 322 aa  342  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  58.98 
 
 		 322 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  57 
 
 		 321 aa  338  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  56.67 
 
 		 375 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  59.09 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  58.04 
 
 		 376 aa  335  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 321 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  58.28 
 
 		 340 aa  332  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  56.46 
 
 		 321 aa  332  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  56.46 
 
 		 321 aa  332  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  55.63 
 
 		 326 aa  329  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  53 
 
 		 329 aa  329  5.0000000000000004e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 321 aa  328  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  58.54 
 
 		 378 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  55.67 
 
 		 344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  57.39 
 
 		 379 aa  327  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  58.39 
 
 		 361 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  53.63 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  57.84 
 
 		 325 aa  322  6e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  56.55 
 
 		 322 aa  321  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  63.05 
 
 		 322 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  51.16 
 
 		 371 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  52.03 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  60.8 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  54.83 
 
 		 321 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  55.52 
 
 		 322 aa  318  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  51.67 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  52.72 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  53.24 
 
 		 371 aa  316  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  55.17 
 
 		 323 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  54.83 
 
 		 375 aa  316  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  54.25 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  52.04 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  52.08 
 
 		 367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  52.12 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.84 
 
 		 367 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  51.54 
 
 		 373 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  59.63 
 
 		 376 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  56.94 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  51.31 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  54.33 
 
 		 330 aa  311  6.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  51.38 
 
 		 357 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  52.03 
 
 		 368 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  55.29 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  53.95 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  52.36 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  51.03 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  56.59 
 
 		 369 aa  310  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  49.83 
 
 		 365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  56.12 
 
 		 375 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  59.26 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  53.55 
 
 		 375 aa  308  6.999999999999999e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  52.92 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  53.95 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  55.52 
 
 		 376 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00072  peptide chain release factor 2  54.08 
 
 		 329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  55.48 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  50.86 
 
 		 364 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  52.04 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  51.47 
 
 		 377 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  51.05 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  51.03 
 
 		 369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  54.83 
 
 		 322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.83 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.48 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  55.52 
 
 		 322 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  52.94 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.48 
 
 		 380 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  50.7 
 
 		 364 aa  305  6e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.48 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  58.27 
 
 		 302 aa  305  7e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  53.61 
 
 		 349 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  54.92 
 
 		 343 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  53.45 
 
 		 375 aa  305  9.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  53.1 
 
 		 365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.86 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  49.48 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  49.48 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  55.17 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  55.05 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  53.1 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  53.1 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  49.48 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  53.1 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  48.43 
 
 		 327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  51.52 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  53.1 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  53.12 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.31 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>