100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5382 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  69.29 
 
 		 139 aa  185  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  67.69 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  69.29 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  59.69 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  60.63 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  61.9 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  49.6 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  49.61 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  52.42 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  50.79 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  50.79 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  48 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  47.15 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  46.34 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  45.97 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  44.35 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  43.41 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  41.13 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  43.2 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  41.6 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  40 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  37.21 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  37.1 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  36.76 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  39.52 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  43.27 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  35.29 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  43.56 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  34.15 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  36.07 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  32.26 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  36.96 
 
 		 305 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  36.69 
 
 		 311 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  36.96 
 
 		 305 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  33.83 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  31.67 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  29.32 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  38.24 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  37.62 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  32.43 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  36.26 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  36.9 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  38.04 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  37.21 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  33.7 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  36.84 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  37.65 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  31.68 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  40.85 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  30.21 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  39.13 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  40.85 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  41.43 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  39.13 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  36.59 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  38.55 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  36.23 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  38.57 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  36.23 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  36.23 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  35.62 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  32 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  37.63 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  37.18 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  35.62 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  37.04 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  33.71 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  33.91 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  29.52 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  36.71 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  34.72 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  30.59 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  32.63 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  37.14 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  28.83 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  35.21 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  40.98 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  41.67 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  30.34 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  40 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  30.39 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1219  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  29.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  30.95 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  28.74 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  33.02 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  30.39 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3653  baseplate assembly protein, putative  39.77 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2306  GPW/gp25 family protein  30 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  30.43 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  33.82 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  30.95 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  36.07 
 
 		 116 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  30.86 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  34.85 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  35 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  34.48 
 
 		 111 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>