74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3831 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 311 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  95.18 
 
 		 305 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  94.86 
 
 		 305 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  39.55 
 
 		 131 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  39.26 
 
 		 136 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  37.12 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  37.5 
 
 		 139 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  34.35 
 
 		 130 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  35.11 
 
 		 130 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  37.98 
 
 		 141 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  36.69 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  37.59 
 
 		 132 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  36.84 
 
 		 133 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  35.11 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  36.09 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  36.3 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  35.34 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  34.85 
 
 		 140 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  36.64 
 
 		 135 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  32.39 
 
 		 146 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  33.58 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  30.37 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  34.81 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  34.56 
 
 		 145 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  34.56 
 
 		 133 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  32.56 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  34.35 
 
 		 139 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  43.42 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  32.09 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  34.31 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  28.78 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  44.12 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  32.86 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  31.43 
 
 		 149 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  36.78 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  31.75 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  43.94 
 
 		 93 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  27.07 
 
 		 151 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  35.11 
 
 		 130 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  32.18 
 
 		 116 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  34.57 
 
 		 117 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  34.29 
 
 		 116 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  34.29 
 
 		 116 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  40 
 
 		 109 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  42.86 
 
 		 125 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1139  hypothetical protein  32.63 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 115 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  32.91 
 
 		 116 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  38.46 
 
 		 108 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  36.67 
 
 		 113 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  37.68 
 
 		 127 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  39.13 
 
 		 108 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  36.92 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  35.38 
 
 		 108 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  32.29 
 
 		 125 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  33.33 
 
 		 115 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  39.71 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  31.65 
 
 		 114 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  30.68 
 
 		 117 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  37.7 
 
 		 99 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  31.88 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  29.29 
 
 		 116 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1747  hypothetical protein  45.1 
 
 		 128 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.547378  normal  0.877557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  37.7 
 
 		 99 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  28.95 
 
 		 139 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  34.57 
 
 		 165 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  32.31 
 
 		 115 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  35 
 
 		 108 aa  43.5  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  33.7 
 
 		 108 aa  42.7  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  30 
 
 		 121 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  36.92 
 
 		 108 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>