66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1908 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 165 aa  330  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  68.75 
 
 		 139 aa  197  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  67.69 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  65.35 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  69.29 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  59.56 
 
 		 145 aa  175  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  53.28 
 
 		 142 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  51.18 
 
 		 145 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  48.03 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  51.56 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  51.56 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  48.39 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  43.55 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  49.61 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  46.34 
 
 		 140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  45.74 
 
 		 136 aa  111  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  43.55 
 
 		 132 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  41.98 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  44.35 
 
 		 131 aa  104  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  40.8 
 
 		 131 aa  101  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  36.17 
 
 		 142 aa  97.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  38.1 
 
 		 133 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  35.2 
 
 		 141 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  36.8 
 
 		 145 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  34.92 
 
 		 145 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  34.62 
 
 		 139 aa  88.2  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  31.25 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 147 aa  84  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  34.33 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  31.01 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  32.03 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  33.07 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  39.09 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  36.89 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  29.17 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  34.85 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  34.85 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  34.85 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  35.37 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  33.85 
 
 		 108 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  34.55 
 
 		 116 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  35 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  29.91 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  34.48 
 
 		 128 aa  48.5  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  35.94 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  32.81 
 
 		 108 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  34.38 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  32.08 
 
 		 125 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  31.25 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  35.82 
 
 		 112 aa  44.7  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  31.58 
 
 		 112 aa  44.3  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  36 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  30.85 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 		 115 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  36.71 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  34.33 
 
 		 119 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  27.08 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  27.37 
 
 		 115 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  33.82 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  37.29 
 
 		 116 aa  41.6  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  29.52 
 
 		 127 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  33.8 
 
 		 116 aa  40.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  33.8 
 
 		 116 aa  40.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0851  hypothetical protein  26.09 
 
 		 120 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>