68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0367 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 141 aa  291  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  55.47 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  52.71 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  52.31 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  50.77 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  47.33 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  47.69 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  44.6 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1044  tail lysozyme, putative  41.01 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2460  hypothetical protein  47.52 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5248  GPW/gp25 family protein  44.2 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3607  tail lysozyme, putative  43.17 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  40.74 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  42.22 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  39.37 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1082  hypothetical protein  38.28 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  39.68 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  36 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  37.21 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  34.81 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  36.36 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  35.77 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  36.22 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  35.2 
 
 		 165 aa  90.1  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1050  GPW/gp25 family protein  30.83 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  34.68 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3607  GPW/gp25 family protein  38.71 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  hitchhiker  0.00124097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  37.68 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  32.8 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  37.01 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0946  Phage baseplate assembly protein W-like  37.98 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3831  GPW/gp25 family protein  37.98 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1875  Phage baseplate assembly protein W-like  37.98 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  32.28 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  34.13 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  30.71 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  32.8 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  32.67 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  39.68 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  37.08 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3045  GPW/gp25 family protein  32.5 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000037696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  30.14 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  25.77 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1813  hypothetical protein  30.68 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651266  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  30.3 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  37.88 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  24.74 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  32.1 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  28.09 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  32.1 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  27.78 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2554  hypothetical protein  31.68 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  30.23 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  30.77 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  31.25 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  29.9 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1491  GPW/gp25 family protein  27.27 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  28.57 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  31.43 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  30.38 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  27.59 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  27.59 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  29.27 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  30.38 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  31.25 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  27.59 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1815  hypothetical protein  28.26 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.976098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  31.33 
 
 		 125 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>